Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL44

Nlrx1, NLR family member X1, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrx1Q3TL44 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nlrx1Q3TL44 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nlrx1Q3TL44 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nlrx1Q3TL44 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nlrx1Q3TL44 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nlrx1Q3TL44 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nlrx1Q3TL44 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nlrx1Q3TL44 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nlrx1Q3TL44 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nlrx1Q3TL44 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nlrx1Q3TL44 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nlrx1Q3TL44 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nlrx1Q3TL44 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nlrx1Q3TL44 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nlrx1Q3TL44 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nlrx1Q3TL44 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nlrx1Q3TL44 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nlrx1Q3TL44 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nlrx1Q3TL44 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nlrx1Q3TL44 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nlrx1Q3TL44 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nlrx1Q3TL44 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nlrx1Q3TL44 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nlrx1Q3TL44 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nlrx1Q3TL44 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nlrx1Q3TL44 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nlrx1Q3TL44 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nlrx1Q3TL44 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nlrx1Q3TL44 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nlrx1Q3TL44 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nlrx1Q3TL44 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Nlrx1Q3TL44 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nlrx1Q3TL44 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nlrx1Q3TL44 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nlrx1Q3TL44 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nlrx1Q3TL44 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nlrx1Q3TL44 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nlrx1Q3TL44 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nlrx1Q3TL44 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nlrx1Q3TL44 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Nlrx1Q3TL44 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nlrx1Q3TL44 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nlrx1Q3TL44 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nlrx1Q3TL44 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nlrx1Q3TL44 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nlrx1Q3TL44 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nlrx1Q3TL44 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nlrx1Q3TL44 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nlrx1Q3TL44 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nlrx1Q3TL44 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nlrx1Q3TL44 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nlrx1Q3TL44 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nlrx1Q3TL44 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Nlrx1Q3TL44 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Nlrx1Q3TL44 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Nlrx1Q3TL44 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nlrx1Q3TL44 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nlrx1Q3TL44 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nlrx1Q3TL44 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nlrx1Q3TL44 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nlrx1Q3TL44 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nlrx1Q3TL44 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nlrx1Q3TL44 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nlrx1Q3TL44 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nlrx1Q3TL44 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nlrx1Q3TL44 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nlrx1Q3TL44 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nlrx1Q3TL44 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nlrx1Q3TL44 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nlrx1Q3TL44 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nlrx1Q3TL44 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nlrx1Q3TL44 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nlrx1Q3TL44 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nlrx1Q3TL44 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nlrx1Q3TL44 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nlrx1Q3TL44 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nlrx1Q3TL44 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nlrx1Q3TL44 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nlrx1Q3TL44 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nlrx1Q3TL44 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nlrx1Q3TL44 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nlrx1Q3TL44 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nlrx1Q3TL44 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nlrx1Q3TL44 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nlrx1Q3TL44 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nlrx1Q3TL44 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nlrx1Q3TL44 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nlrx1Q3TL44 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nlrx1Q3TL44 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nlrx1Q3TL44 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nlrx1Q3TL44 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nlrx1Q3TL44 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nlrx1Q3TL44 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nlrx1Q3TL44 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nlrx1Q3TL44 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nlrx1Q3TL44 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nlrx1Q3TL44 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nlrx1Q3TL44 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nlrx1Q3TL44 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nlrx1Q3TL44 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms