Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYK4

Vrtn, Vertnin, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VrtnQ3SYK4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VrtnQ3SYK4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
VrtnQ3SYK4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VrtnQ3SYK4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VrtnQ3SYK4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VrtnQ3SYK4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VrtnQ3SYK4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VrtnQ3SYK4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VrtnQ3SYK4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VrtnQ3SYK4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VrtnQ3SYK4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
VrtnQ3SYK4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VrtnQ3SYK4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VrtnQ3SYK4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VrtnQ3SYK4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VrtnQ3SYK4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VrtnQ3SYK4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VrtnQ3SYK4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VrtnQ3SYK4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VrtnQ3SYK4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VrtnQ3SYK4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VrtnQ3SYK4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VrtnQ3SYK4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
VrtnQ3SYK4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VrtnQ3SYK4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VrtnQ3SYK4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VrtnQ3SYK4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VrtnQ3SYK4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VrtnQ3SYK4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VrtnQ3SYK4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VrtnQ3SYK4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VrtnQ3SYK4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VrtnQ3SYK4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VrtnQ3SYK4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VrtnQ3SYK4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VrtnQ3SYK4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VrtnQ3SYK4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
VrtnQ3SYK4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VrtnQ3SYK4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
VrtnQ3SYK4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VrtnQ3SYK4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VrtnQ3SYK4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VrtnQ3SYK4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VrtnQ3SYK4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VrtnQ3SYK4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VrtnQ3SYK4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VrtnQ3SYK4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VrtnQ3SYK4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
VrtnQ3SYK4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VrtnQ3SYK4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VrtnQ3SYK4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VrtnQ3SYK4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
VrtnQ3SYK4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VrtnQ3SYK4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VrtnQ3SYK4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VrtnQ3SYK4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VrtnQ3SYK4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VrtnQ3SYK4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VrtnQ3SYK4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VrtnQ3SYK4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VrtnQ3SYK4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VrtnQ3SYK4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VrtnQ3SYK4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VrtnQ3SYK4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VrtnQ3SYK4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VrtnQ3SYK4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VrtnQ3SYK4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VrtnQ3SYK4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VrtnQ3SYK4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VrtnQ3SYK4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VrtnQ3SYK4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VrtnQ3SYK4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VrtnQ3SYK4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VrtnQ3SYK4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VrtnQ3SYK4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VrtnQ3SYK4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VrtnQ3SYK4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VrtnQ3SYK4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VrtnQ3SYK4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VrtnQ3SYK4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VrtnQ3SYK4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VrtnQ3SYK4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VrtnQ3SYK4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
VrtnQ3SYK4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VrtnQ3SYK4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VrtnQ3SYK4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VrtnQ3SYK4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VrtnQ3SYK4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VrtnQ3SYK4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VrtnQ3SYK4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VrtnQ3SYK4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VrtnQ3SYK4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VrtnQ3SYK4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VrtnQ3SYK4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
VrtnQ3SYK4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VrtnQ3SYK4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VrtnQ3SYK4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VrtnQ3SYK4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VrtnQ3SYK4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VrtnQ3SYK4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147.7 ms