Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNM2

March5, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH5, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
March5Q3KNM2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
March5Q3KNM2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
March5Q3KNM2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
March5Q3KNM2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
March5Q3KNM2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
March5Q3KNM2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
March5Q3KNM2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
March5Q3KNM2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
March5Q3KNM2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
March5Q3KNM2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
March5Q3KNM2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
March5Q3KNM2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
March5Q3KNM2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
March5Q3KNM2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
March5Q3KNM2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
March5Q3KNM2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
March5Q3KNM2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
March5Q3KNM2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
March5Q3KNM2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
March5Q3KNM2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
March5Q3KNM2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
March5Q3KNM2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
March5Q3KNM2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
March5Q3KNM2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
March5Q3KNM2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
March5Q3KNM2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
March5Q3KNM2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
March5Q3KNM2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
March5Q3KNM2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
March5Q3KNM2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
March5Q3KNM2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
March5Q3KNM2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
March5Q3KNM2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
March5Q3KNM2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
March5Q3KNM2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
March5Q3KNM2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
March5Q3KNM2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
March5Q3KNM2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
March5Q3KNM2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
March5Q3KNM2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
March5Q3KNM2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
March5Q3KNM2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
March5Q3KNM2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
March5Q3KNM2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
March5Q3KNM2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
March5Q3KNM2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
March5Q3KNM2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
March5Q3KNM2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
March5Q3KNM2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
March5Q3KNM2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
March5Q3KNM2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
March5Q3KNM2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
March5Q3KNM2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
March5Q3KNM2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
March5Q3KNM2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
March5Q3KNM2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
March5Q3KNM2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
March5Q3KNM2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
March5Q3KNM2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
March5Q3KNM2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
March5Q3KNM2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
March5Q3KNM2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
March5Q3KNM2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
March5Q3KNM2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
March5Q3KNM2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
March5Q3KNM2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
March5Q3KNM2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
March5Q3KNM2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
March5Q3KNM2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
March5Q3KNM2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
March5Q3KNM2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
March5Q3KNM2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
March5Q3KNM2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
March5Q3KNM2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
March5Q3KNM2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
March5Q3KNM2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
March5Q3KNM2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
March5Q3KNM2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
March5Q3KNM2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
March5Q3KNM2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
March5Q3KNM2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
March5Q3KNM2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
March5Q3KNM2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
March5Q3KNM2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
March5Q3KNM2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
March5Q3KNM2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
March5Q3KNM2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
March5Q3KNM2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
March5Q3KNM2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
March5Q3KNM2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
March5Q3KNM2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
March5Q3KNM2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
March5Q3KNM2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
March5Q3KNM2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
March5Q3KNM2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
March5Q3KNM2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
March5Q3KNM2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
March5Q3KNM2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
March5Q3KNM2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
March5Q3KNM2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms