Protein–RNA interactions for Protein: Q14BE7

Fam47c, Family with sequence similarity 47, member A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam47cQ14BE7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam47cQ14BE7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam47cQ14BE7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam47cQ14BE7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam47cQ14BE7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam47cQ14BE7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam47cQ14BE7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam47cQ14BE7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam47cQ14BE7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam47cQ14BE7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam47cQ14BE7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam47cQ14BE7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam47cQ14BE7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam47cQ14BE7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam47cQ14BE7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam47cQ14BE7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam47cQ14BE7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam47cQ14BE7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam47cQ14BE7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam47cQ14BE7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam47cQ14BE7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam47cQ14BE7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam47cQ14BE7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam47cQ14BE7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam47cQ14BE7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam47cQ14BE7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam47cQ14BE7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam47cQ14BE7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam47cQ14BE7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam47cQ14BE7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam47cQ14BE7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam47cQ14BE7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam47cQ14BE7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam47cQ14BE7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam47cQ14BE7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam47cQ14BE7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam47cQ14BE7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam47cQ14BE7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam47cQ14BE7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam47cQ14BE7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam47cQ14BE7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam47cQ14BE7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam47cQ14BE7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam47cQ14BE7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam47cQ14BE7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam47cQ14BE7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam47cQ14BE7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam47cQ14BE7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam47cQ14BE7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam47cQ14BE7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam47cQ14BE7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam47cQ14BE7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam47cQ14BE7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam47cQ14BE7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam47cQ14BE7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam47cQ14BE7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam47cQ14BE7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam47cQ14BE7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam47cQ14BE7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam47cQ14BE7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam47cQ14BE7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam47cQ14BE7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam47cQ14BE7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam47cQ14BE7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam47cQ14BE7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam47cQ14BE7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam47cQ14BE7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam47cQ14BE7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam47cQ14BE7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam47cQ14BE7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam47cQ14BE7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fam47cQ14BE7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam47cQ14BE7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam47cQ14BE7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam47cQ14BE7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam47cQ14BE7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam47cQ14BE7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam47cQ14BE7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam47cQ14BE7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam47cQ14BE7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam47cQ14BE7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam47cQ14BE7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam47cQ14BE7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam47cQ14BE7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam47cQ14BE7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam47cQ14BE7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam47cQ14BE7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam47cQ14BE7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam47cQ14BE7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam47cQ14BE7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam47cQ14BE7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam47cQ14BE7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam47cQ14BE7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam47cQ14BE7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam47cQ14BE7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam47cQ14BE7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam47cQ14BE7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam47cQ14BE7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam47cQ14BE7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam47cQ14BE7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms