Protein–RNA interactions for Protein: Q0P678

Zc3h18, Zinc finger CCCH domain-containing protein 18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h18Q0P678 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zc3h18Q0P678 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Zc3h18Q0P678 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zc3h18Q0P678 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zc3h18Q0P678 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zc3h18Q0P678 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zc3h18Q0P678 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zc3h18Q0P678 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zc3h18Q0P678 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zc3h18Q0P678 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zc3h18Q0P678 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zc3h18Q0P678 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zc3h18Q0P678 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zc3h18Q0P678 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zc3h18Q0P678 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zc3h18Q0P678 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zc3h18Q0P678 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zc3h18Q0P678 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zc3h18Q0P678 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zc3h18Q0P678 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zc3h18Q0P678 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zc3h18Q0P678 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zc3h18Q0P678 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zc3h18Q0P678 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zc3h18Q0P678 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zc3h18Q0P678 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zc3h18Q0P678 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zc3h18Q0P678 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zc3h18Q0P678 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zc3h18Q0P678 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Zc3h18Q0P678 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zc3h18Q0P678 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zc3h18Q0P678 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zc3h18Q0P678 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zc3h18Q0P678 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Zc3h18Q0P678 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zc3h18Q0P678 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zc3h18Q0P678 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Zc3h18Q0P678 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Zc3h18Q0P678 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Zc3h18Q0P678 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zc3h18Q0P678 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zc3h18Q0P678 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zc3h18Q0P678 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zc3h18Q0P678 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zc3h18Q0P678 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zc3h18Q0P678 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zc3h18Q0P678 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Zc3h18Q0P678 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zc3h18Q0P678 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zc3h18Q0P678 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zc3h18Q0P678 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Zc3h18Q0P678 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zc3h18Q0P678 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zc3h18Q0P678 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zc3h18Q0P678 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zc3h18Q0P678 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zc3h18Q0P678 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zc3h18Q0P678 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zc3h18Q0P678 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zc3h18Q0P678 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zc3h18Q0P678 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zc3h18Q0P678 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Zc3h18Q0P678 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zc3h18Q0P678 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zc3h18Q0P678 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zc3h18Q0P678 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zc3h18Q0P678 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zc3h18Q0P678 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zc3h18Q0P678 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zc3h18Q0P678 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zc3h18Q0P678 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zc3h18Q0P678 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zc3h18Q0P678 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zc3h18Q0P678 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zc3h18Q0P678 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zc3h18Q0P678 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zc3h18Q0P678 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zc3h18Q0P678 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zc3h18Q0P678 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zc3h18Q0P678 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zc3h18Q0P678 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zc3h18Q0P678 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zc3h18Q0P678 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zc3h18Q0P678 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zc3h18Q0P678 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zc3h18Q0P678 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zc3h18Q0P678 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zc3h18Q0P678 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zc3h18Q0P678 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zc3h18Q0P678 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zc3h18Q0P678 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Zc3h18Q0P678 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Zc3h18Q0P678 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zc3h18Q0P678 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zc3h18Q0P678 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zc3h18Q0P678 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zc3h18Q0P678 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zc3h18Q0P678 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zc3h18Q0P678 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms