Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MitfQ08874 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MitfQ08874 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MitfQ08874 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MitfQ08874 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MitfQ08874 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MitfQ08874 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
MitfQ08874 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MitfQ08874 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MitfQ08874 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MitfQ08874 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MitfQ08874 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MitfQ08874 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MitfQ08874 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MitfQ08874 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
MitfQ08874 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MitfQ08874 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MitfQ08874 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MitfQ08874 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MitfQ08874 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MitfQ08874 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MitfQ08874 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MitfQ08874 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MitfQ08874 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MitfQ08874 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MitfQ08874 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MitfQ08874 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MitfQ08874 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MitfQ08874 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MitfQ08874 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MitfQ08874 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MitfQ08874 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
MitfQ08874 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MitfQ08874 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MitfQ08874 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MitfQ08874 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MitfQ08874 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MitfQ08874 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
MitfQ08874 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
MitfQ08874 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MitfQ08874 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MitfQ08874 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MitfQ08874 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MitfQ08874 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MitfQ08874 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MitfQ08874 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MitfQ08874 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MitfQ08874 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MitfQ08874 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MitfQ08874 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MitfQ08874 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MitfQ08874 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
MitfQ08874 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MitfQ08874 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MitfQ08874 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MitfQ08874 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MitfQ08874 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MitfQ08874 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
MitfQ08874 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MitfQ08874 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MitfQ08874 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MitfQ08874 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MitfQ08874 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MitfQ08874 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MitfQ08874 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MitfQ08874 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MitfQ08874 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MitfQ08874 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
MitfQ08874 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MitfQ08874 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MitfQ08874 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MitfQ08874 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MitfQ08874 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MitfQ08874 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MitfQ08874 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MitfQ08874 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MitfQ08874 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MitfQ08874 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MitfQ08874 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MitfQ08874 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MitfQ08874 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MitfQ08874 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MitfQ08874 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MitfQ08874 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MitfQ08874 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MitfQ08874 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MitfQ08874 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MitfQ08874 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MitfQ08874 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MitfQ08874 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MitfQ08874 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MitfQ08874 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MitfQ08874 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MitfQ08874 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MitfQ08874 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MitfQ08874 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MitfQ08874 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MitfQ08874 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MitfQ08874 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
MitfQ08874 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.8 ms