Protein–RNA interactions for Protein: Q08639

Tfdp1, Transcription factor Dp-1, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfdp1Q08639 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tfdp1Q08639 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tfdp1Q08639 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tfdp1Q08639 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tfdp1Q08639 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tfdp1Q08639 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tfdp1Q08639 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tfdp1Q08639 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tfdp1Q08639 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tfdp1Q08639 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tfdp1Q08639 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tfdp1Q08639 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tfdp1Q08639 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tfdp1Q08639 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tfdp1Q08639 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tfdp1Q08639 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tfdp1Q08639 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tfdp1Q08639 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tfdp1Q08639 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tfdp1Q08639 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tfdp1Q08639 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tfdp1Q08639 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tfdp1Q08639 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tfdp1Q08639 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tfdp1Q08639 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tfdp1Q08639 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tfdp1Q08639 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tfdp1Q08639 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tfdp1Q08639 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tfdp1Q08639 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tfdp1Q08639 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tfdp1Q08639 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tfdp1Q08639 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tfdp1Q08639 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tfdp1Q08639 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tfdp1Q08639 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tfdp1Q08639 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tfdp1Q08639 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tfdp1Q08639 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tfdp1Q08639 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tfdp1Q08639 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tfdp1Q08639 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tfdp1Q08639 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tfdp1Q08639 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tfdp1Q08639 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tfdp1Q08639 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tfdp1Q08639 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tfdp1Q08639 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tfdp1Q08639 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tfdp1Q08639 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tfdp1Q08639 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tfdp1Q08639 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tfdp1Q08639 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tfdp1Q08639 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tfdp1Q08639 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tfdp1Q08639 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tfdp1Q08639 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tfdp1Q08639 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tfdp1Q08639 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tfdp1Q08639 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tfdp1Q08639 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tfdp1Q08639 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tfdp1Q08639 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tfdp1Q08639 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tfdp1Q08639 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tfdp1Q08639 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tfdp1Q08639 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tfdp1Q08639 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tfdp1Q08639 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tfdp1Q08639 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tfdp1Q08639 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tfdp1Q08639 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tfdp1Q08639 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tfdp1Q08639 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tfdp1Q08639 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tfdp1Q08639 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tfdp1Q08639 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tfdp1Q08639 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tfdp1Q08639 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tfdp1Q08639 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tfdp1Q08639 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tfdp1Q08639 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tfdp1Q08639 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tfdp1Q08639 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tfdp1Q08639 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tfdp1Q08639 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tfdp1Q08639 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tfdp1Q08639 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tfdp1Q08639 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tfdp1Q08639 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tfdp1Q08639 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tfdp1Q08639 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Tfdp1Q08639 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tfdp1Q08639 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tfdp1Q08639 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Tfdp1Q08639 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tfdp1Q08639 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tfdp1Q08639 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tfdp1Q08639 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tfdp1Q08639 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms