Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kcnma1Q08460 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kcnma1Q08460 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Kcnma1Q08460 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kcnma1Q08460 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kcnma1Q08460 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kcnma1Q08460 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kcnma1Q08460 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kcnma1Q08460 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kcnma1Q08460 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kcnma1Q08460 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Kcnma1Q08460 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kcnma1Q08460 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kcnma1Q08460 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kcnma1Q08460 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcnma1Q08460 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcnma1Q08460 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcnma1Q08460 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcnma1Q08460 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcnma1Q08460 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcnma1Q08460 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcnma1Q08460 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcnma1Q08460 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcnma1Q08460 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcnma1Q08460 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcnma1Q08460 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcnma1Q08460 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kcnma1Q08460 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kcnma1Q08460 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kcnma1Q08460 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kcnma1Q08460 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kcnma1Q08460 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kcnma1Q08460 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kcnma1Q08460 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kcnma1Q08460 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Kcnma1Q08460 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Kcnma1Q08460 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kcnma1Q08460 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kcnma1Q08460 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kcnma1Q08460 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kcnma1Q08460 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Kcnma1Q08460 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kcnma1Q08460 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kcnma1Q08460 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kcnma1Q08460 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kcnma1Q08460 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kcnma1Q08460 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Kcnma1Q08460 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kcnma1Q08460 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kcnma1Q08460 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kcnma1Q08460 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Kcnma1Q08460 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kcnma1Q08460 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Kcnma1Q08460 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kcnma1Q08460 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kcnma1Q08460 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Kcnma1Q08460 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kcnma1Q08460 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kcnma1Q08460 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kcnma1Q08460 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kcnma1Q08460 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kcnma1Q08460 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kcnma1Q08460 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kcnma1Q08460 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kcnma1Q08460 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kcnma1Q08460 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kcnma1Q08460 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kcnma1Q08460 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kcnma1Q08460 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kcnma1Q08460 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kcnma1Q08460 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kcnma1Q08460 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kcnma1Q08460 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kcnma1Q08460 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kcnma1Q08460 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kcnma1Q08460 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kcnma1Q08460 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kcnma1Q08460 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kcnma1Q08460 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kcnma1Q08460 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kcnma1Q08460 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Kcnma1Q08460 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kcnma1Q08460 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kcnma1Q08460 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kcnma1Q08460 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kcnma1Q08460 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kcnma1Q08460 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kcnma1Q08460 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kcnma1Q08460 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Kcnma1Q08460 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kcnma1Q08460 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kcnma1Q08460 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kcnma1Q08460 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kcnma1Q08460 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kcnma1Q08460 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kcnma1Q08460 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kcnma1Q08460 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kcnma1Q08460 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kcnma1Q08460 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kcnma1Q08460 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms