Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col9a2Q07643 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col9a2Q07643 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col9a2Q07643 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col9a2Q07643 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col9a2Q07643 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col9a2Q07643 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col9a2Q07643 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col9a2Q07643 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col9a2Q07643 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col9a2Q07643 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Col9a2Q07643 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col9a2Q07643 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col9a2Q07643 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col9a2Q07643 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col9a2Q07643 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col9a2Q07643 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col9a2Q07643 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col9a2Q07643 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col9a2Q07643 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col9a2Q07643 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col9a2Q07643 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col9a2Q07643 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col9a2Q07643 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col9a2Q07643 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col9a2Q07643 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col9a2Q07643 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col9a2Q07643 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col9a2Q07643 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col9a2Q07643 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col9a2Q07643 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col9a2Q07643 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col9a2Q07643 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col9a2Q07643 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col9a2Q07643 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col9a2Q07643 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col9a2Q07643 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col9a2Q07643 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col9a2Q07643 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col9a2Q07643 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col9a2Q07643 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col9a2Q07643 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col9a2Q07643 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col9a2Q07643 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col9a2Q07643 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col9a2Q07643 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col9a2Q07643 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Col9a2Q07643 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Col9a2Q07643 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col9a2Q07643 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col9a2Q07643 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col9a2Q07643 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col9a2Q07643 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col9a2Q07643 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col9a2Q07643 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col9a2Q07643 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col9a2Q07643 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col9a2Q07643 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col9a2Q07643 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col9a2Q07643 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col9a2Q07643 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col9a2Q07643 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col9a2Q07643 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col9a2Q07643 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col9a2Q07643 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col9a2Q07643 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col9a2Q07643 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col9a2Q07643 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col9a2Q07643 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Col9a2Q07643 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col9a2Q07643 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col9a2Q07643 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col9a2Q07643 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col9a2Q07643 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col9a2Q07643 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col9a2Q07643 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col9a2Q07643 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col9a2Q07643 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col9a2Q07643 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col9a2Q07643 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col9a2Q07643 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col9a2Q07643 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col9a2Q07643 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col9a2Q07643 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col9a2Q07643 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col9a2Q07643 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col9a2Q07643 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Col9a2Q07643 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col9a2Q07643 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col9a2Q07643 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col9a2Q07643 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Col9a2Q07643 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col9a2Q07643 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col9a2Q07643 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col9a2Q07643 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col9a2Q07643 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col9a2Q07643 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col9a2Q07643 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col9a2Q07643 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Col9a2Q07643 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms