Protein–RNA interactions for Protein: Q05A80

Caprin2, Caprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin2Q05A80 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Caprin2Q05A80 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Caprin2Q05A80 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Caprin2Q05A80 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Caprin2Q05A80 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Caprin2Q05A80 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Caprin2Q05A80 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Caprin2Q05A80 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Caprin2Q05A80 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Caprin2Q05A80 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Caprin2Q05A80 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Caprin2Q05A80 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Caprin2Q05A80 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Caprin2Q05A80 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Caprin2Q05A80 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Caprin2Q05A80 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Caprin2Q05A80 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Caprin2Q05A80 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Caprin2Q05A80 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Caprin2Q05A80 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Caprin2Q05A80 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Caprin2Q05A80 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Caprin2Q05A80 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Caprin2Q05A80 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Caprin2Q05A80 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Caprin2Q05A80 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Caprin2Q05A80 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Caprin2Q05A80 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Caprin2Q05A80 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Caprin2Q05A80 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Caprin2Q05A80 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Caprin2Q05A80 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Caprin2Q05A80 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Caprin2Q05A80 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Caprin2Q05A80 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Caprin2Q05A80 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Caprin2Q05A80 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Caprin2Q05A80 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Caprin2Q05A80 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Caprin2Q05A80 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Caprin2Q05A80 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Caprin2Q05A80 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Caprin2Q05A80 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Caprin2Q05A80 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Caprin2Q05A80 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Caprin2Q05A80 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Caprin2Q05A80 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Caprin2Q05A80 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Caprin2Q05A80 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Caprin2Q05A80 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Caprin2Q05A80 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Caprin2Q05A80 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Caprin2Q05A80 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Caprin2Q05A80 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Caprin2Q05A80 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Caprin2Q05A80 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Caprin2Q05A80 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Caprin2Q05A80 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Caprin2Q05A80 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Caprin2Q05A80 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Caprin2Q05A80 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Caprin2Q05A80 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Caprin2Q05A80 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Caprin2Q05A80 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Caprin2Q05A80 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Caprin2Q05A80 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Caprin2Q05A80 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Caprin2Q05A80 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Caprin2Q05A80 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Caprin2Q05A80 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Caprin2Q05A80 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Caprin2Q05A80 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Caprin2Q05A80 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Caprin2Q05A80 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Caprin2Q05A80 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Caprin2Q05A80 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Caprin2Q05A80 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Caprin2Q05A80 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Caprin2Q05A80 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Caprin2Q05A80 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Caprin2Q05A80 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Caprin2Q05A80 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Caprin2Q05A80 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Caprin2Q05A80 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Caprin2Q05A80 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Caprin2Q05A80 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Caprin2Q05A80 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Caprin2Q05A80 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Caprin2Q05A80 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Caprin2Q05A80 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Caprin2Q05A80 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Caprin2Q05A80 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Caprin2Q05A80 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Caprin2Q05A80 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Caprin2Q05A80 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Caprin2Q05A80 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Caprin2Q05A80 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Caprin2Q05A80 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Caprin2Q05A80 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Caprin2Q05A80 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms