Protein–RNA interactions for Protein: Q05A06

Vmn1r236, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r236Q05A06 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Vmn1r236Q05A06 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Vmn1r236Q05A06 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r236Q05A06 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r236Q05A06 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r236Q05A06 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r236Q05A06 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r236Q05A06 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r236Q05A06 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r236Q05A06 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r236Q05A06 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r236Q05A06 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r236Q05A06 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r236Q05A06 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r236Q05A06 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r236Q05A06 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r236Q05A06 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r236Q05A06 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r236Q05A06 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r236Q05A06 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r236Q05A06 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r236Q05A06 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r236Q05A06 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r236Q05A06 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r236Q05A06 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r236Q05A06 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r236Q05A06 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r236Q05A06 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r236Q05A06 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r236Q05A06 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r236Q05A06 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r236Q05A06 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r236Q05A06 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r236Q05A06 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r236Q05A06 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r236Q05A06 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r236Q05A06 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r236Q05A06 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r236Q05A06 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r236Q05A06 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r236Q05A06 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r236Q05A06 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r236Q05A06 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r236Q05A06 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r236Q05A06 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r236Q05A06 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r236Q05A06 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r236Q05A06 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r236Q05A06 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r236Q05A06 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r236Q05A06 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r236Q05A06 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r236Q05A06 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r236Q05A06 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r236Q05A06 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r236Q05A06 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r236Q05A06 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r236Q05A06 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r236Q05A06 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r236Q05A06 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r236Q05A06 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r236Q05A06 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r236Q05A06 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r236Q05A06 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r236Q05A06 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r236Q05A06 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r236Q05A06 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r236Q05A06 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r236Q05A06 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r236Q05A06 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r236Q05A06 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r236Q05A06 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r236Q05A06 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r236Q05A06 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r236Q05A06 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r236Q05A06 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r236Q05A06 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r236Q05A06 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r236Q05A06 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r236Q05A06 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r236Q05A06 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r236Q05A06 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r236Q05A06 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r236Q05A06 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r236Q05A06 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r236Q05A06 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r236Q05A06 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r236Q05A06 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r236Q05A06 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r236Q05A06 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r236Q05A06 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r236Q05A06 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r236Q05A06 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r236Q05A06 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r236Q05A06 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r236Q05A06 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r236Q05A06 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r236Q05A06 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r236Q05A06 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r236Q05A06 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms