Protein–RNA interactions for Protein: P97477

Aurka, Aurora kinase A, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkaP97477 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AurkaP97477 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AurkaP97477 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AurkaP97477 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AurkaP97477 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AurkaP97477 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AurkaP97477 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AurkaP97477 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AurkaP97477 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AurkaP97477 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AurkaP97477 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AurkaP97477 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AurkaP97477 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AurkaP97477 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AurkaP97477 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AurkaP97477 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AurkaP97477 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AurkaP97477 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AurkaP97477 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AurkaP97477 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AurkaP97477 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AurkaP97477 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AurkaP97477 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AurkaP97477 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AurkaP97477 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AurkaP97477 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AurkaP97477 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AurkaP97477 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AurkaP97477 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AurkaP97477 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AurkaP97477 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AurkaP97477 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AurkaP97477 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AurkaP97477 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.32■■□□□ 1
AurkaP97477 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AurkaP97477 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AurkaP97477 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AurkaP97477 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AurkaP97477 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AurkaP97477 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AurkaP97477 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AurkaP97477 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AurkaP97477 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AurkaP97477 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AurkaP97477 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AurkaP97477 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AurkaP97477 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.31■■□□□ 1
AurkaP97477 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AurkaP97477 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AurkaP97477 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AurkaP97477 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
AurkaP97477 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
AurkaP97477 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AurkaP97477 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AurkaP97477 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AurkaP97477 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AurkaP97477 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AurkaP97477 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AurkaP97477 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AurkaP97477 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AurkaP97477 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AurkaP97477 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AurkaP97477 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AurkaP97477 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AurkaP97477 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AurkaP97477 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AurkaP97477 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AurkaP97477 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AurkaP97477 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AurkaP97477 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
AurkaP97477 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
AurkaP97477 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
AurkaP97477 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AurkaP97477 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
AurkaP97477 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.27■■□□□ 1
AurkaP97477 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AurkaP97477 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AurkaP97477 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AurkaP97477 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
AurkaP97477 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AurkaP97477 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AurkaP97477 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
AurkaP97477 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AurkaP97477 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AurkaP97477 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AurkaP97477 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AurkaP97477 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AurkaP97477 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AurkaP97477 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AurkaP97477 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AurkaP97477 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AurkaP97477 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
AurkaP97477 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AurkaP97477 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AurkaP97477 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AurkaP97477 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AurkaP97477 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AurkaP97477 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AurkaP97477 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AurkaP97477 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms