Protein–RNA interactions for Protein: P97367

Meis2, Homeobox protein Meis2, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis2P97367 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Meis2P97367 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Meis2P97367 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Meis2P97367 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Meis2P97367 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Meis2P97367 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Meis2P97367 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Meis2P97367 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Meis2P97367 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Meis2P97367 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Meis2P97367 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Meis2P97367 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Meis2P97367 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Meis2P97367 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Meis2P97367 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Meis2P97367 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Meis2P97367 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Meis2P97367 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Meis2P97367 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Meis2P97367 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Meis2P97367 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Meis2P97367 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Meis2P97367 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Meis2P97367 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Meis2P97367 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Meis2P97367 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Meis2P97367 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Meis2P97367 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Meis2P97367 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Meis2P97367 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Meis2P97367 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Meis2P97367 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Meis2P97367 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Meis2P97367 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Meis2P97367 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Meis2P97367 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Meis2P97367 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Meis2P97367 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Meis2P97367 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Meis2P97367 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Meis2P97367 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Meis2P97367 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Meis2P97367 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Meis2P97367 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Meis2P97367 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Meis2P97367 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Meis2P97367 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Meis2P97367 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Meis2P97367 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Meis2P97367 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Meis2P97367 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Meis2P97367 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Meis2P97367 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Meis2P97367 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Meis2P97367 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Meis2P97367 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Meis2P97367 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Meis2P97367 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Meis2P97367 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Meis2P97367 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Meis2P97367 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Meis2P97367 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Meis2P97367 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Meis2P97367 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Meis2P97367 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Meis2P97367 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Meis2P97367 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Meis2P97367 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Meis2P97367 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Meis2P97367 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Meis2P97367 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Meis2P97367 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Meis2P97367 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Meis2P97367 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Meis2P97367 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Meis2P97367 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Meis2P97367 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Meis2P97367 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Meis2P97367 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Meis2P97367 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Meis2P97367 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Meis2P97367 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Meis2P97367 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Meis2P97367 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Meis2P97367 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Meis2P97367 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Meis2P97367 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Meis2P97367 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Meis2P97367 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Meis2P97367 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Meis2P97367 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Meis2P97367 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Meis2P97367 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Meis2P97367 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Meis2P97367 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Meis2P97367 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Meis2P97367 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Meis2P97367 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Meis2P97367 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Meis2P97367 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms