Protein–RNA interactions for Protein: P83940

Eloc, Elongin-C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElocP83940 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ElocP83940 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ElocP83940 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ElocP83940 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ElocP83940 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ElocP83940 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ElocP83940 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ElocP83940 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ElocP83940 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ElocP83940 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ElocP83940 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ElocP83940 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ElocP83940 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ElocP83940 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ElocP83940 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ElocP83940 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ElocP83940 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ElocP83940 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ElocP83940 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ElocP83940 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ElocP83940 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ElocP83940 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ElocP83940 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ElocP83940 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ElocP83940 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ElocP83940 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ElocP83940 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ElocP83940 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ElocP83940 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ElocP83940 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ElocP83940 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ElocP83940 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ElocP83940 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ElocP83940 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ElocP83940 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ElocP83940 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ElocP83940 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ElocP83940 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ElocP83940 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ElocP83940 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ElocP83940 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ElocP83940 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ElocP83940 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ElocP83940 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ElocP83940 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ElocP83940 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ElocP83940 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ElocP83940 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ElocP83940 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ElocP83940 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ElocP83940 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ElocP83940 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ElocP83940 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ElocP83940 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ElocP83940 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ElocP83940 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ElocP83940 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ElocP83940 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ElocP83940 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ElocP83940 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ElocP83940 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ElocP83940 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ElocP83940 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ElocP83940 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ElocP83940 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ElocP83940 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ElocP83940 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ElocP83940 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ElocP83940 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ElocP83940 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ElocP83940 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ElocP83940 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ElocP83940 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ElocP83940 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ElocP83940 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ElocP83940 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ElocP83940 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ElocP83940 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ElocP83940 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ElocP83940 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ElocP83940 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ElocP83940 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ElocP83940 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ElocP83940 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ElocP83940 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ElocP83940 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ElocP83940 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ElocP83940 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ElocP83940 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ElocP83940 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ElocP83940 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ElocP83940 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ElocP83940 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ElocP83940 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ElocP83940 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ElocP83940 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ElocP83940 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ElocP83940 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ElocP83940 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ElocP83940 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms