Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otx1P80205 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Otx1P80205 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otx1P80205 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otx1P80205 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otx1P80205 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otx1P80205 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otx1P80205 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otx1P80205 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Otx1P80205 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Otx1P80205 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Otx1P80205 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Otx1P80205 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Otx1P80205 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Otx1P80205 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Otx1P80205 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Otx1P80205 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Otx1P80205 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Otx1P80205 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Otx1P80205 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Otx1P80205 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Otx1P80205 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Otx1P80205 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Otx1P80205 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Otx1P80205 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Otx1P80205 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Otx1P80205 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Otx1P80205 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Otx1P80205 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Otx1P80205 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Otx1P80205 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Otx1P80205 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Otx1P80205 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Otx1P80205 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Otx1P80205 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otx1P80205 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otx1P80205 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otx1P80205 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otx1P80205 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otx1P80205 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otx1P80205 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otx1P80205 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otx1P80205 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Otx1P80205 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Otx1P80205 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Otx1P80205 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Otx1P80205 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Otx1P80205 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Otx1P80205 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otx1P80205 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otx1P80205 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otx1P80205 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otx1P80205 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otx1P80205 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otx1P80205 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otx1P80205 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otx1P80205 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otx1P80205 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otx1P80205 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otx1P80205 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otx1P80205 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otx1P80205 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otx1P80205 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otx1P80205 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otx1P80205 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otx1P80205 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otx1P80205 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otx1P80205 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otx1P80205 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otx1P80205 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otx1P80205 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otx1P80205 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otx1P80205 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Otx1P80205 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otx1P80205 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otx1P80205 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otx1P80205 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otx1P80205 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otx1P80205 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otx1P80205 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otx1P80205 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otx1P80205 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otx1P80205 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otx1P80205 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otx1P80205 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otx1P80205 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otx1P80205 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otx1P80205 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otx1P80205 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otx1P80205 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otx1P80205 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otx1P80205 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otx1P80205 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otx1P80205 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otx1P80205 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otx1P80205 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otx1P80205 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otx1P80205 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otx1P80205 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Otx1P80205 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms