Protein–RNA interactions for Protein: P79621

Ciita, MHC class II transactivator, mousemouse

Predictions only

Length 1,155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiitaP79621 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CiitaP79621 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CiitaP79621 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CiitaP79621 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CiitaP79621 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CiitaP79621 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CiitaP79621 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CiitaP79621 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CiitaP79621 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CiitaP79621 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CiitaP79621 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CiitaP79621 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CiitaP79621 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CiitaP79621 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CiitaP79621 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CiitaP79621 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CiitaP79621 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CiitaP79621 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CiitaP79621 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CiitaP79621 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CiitaP79621 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CiitaP79621 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CiitaP79621 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CiitaP79621 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CiitaP79621 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CiitaP79621 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CiitaP79621 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CiitaP79621 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CiitaP79621 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CiitaP79621 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CiitaP79621 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CiitaP79621 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CiitaP79621 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CiitaP79621 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CiitaP79621 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CiitaP79621 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CiitaP79621 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CiitaP79621 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CiitaP79621 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CiitaP79621 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CiitaP79621 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CiitaP79621 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CiitaP79621 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CiitaP79621 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CiitaP79621 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CiitaP79621 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CiitaP79621 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CiitaP79621 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CiitaP79621 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CiitaP79621 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CiitaP79621 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CiitaP79621 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CiitaP79621 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CiitaP79621 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CiitaP79621 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CiitaP79621 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CiitaP79621 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CiitaP79621 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CiitaP79621 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CiitaP79621 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CiitaP79621 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CiitaP79621 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CiitaP79621 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CiitaP79621 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CiitaP79621 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CiitaP79621 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CiitaP79621 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CiitaP79621 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CiitaP79621 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CiitaP79621 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CiitaP79621 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CiitaP79621 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CiitaP79621 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CiitaP79621 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CiitaP79621 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CiitaP79621 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CiitaP79621 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CiitaP79621 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CiitaP79621 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CiitaP79621 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CiitaP79621 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CiitaP79621 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CiitaP79621 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CiitaP79621 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CiitaP79621 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CiitaP79621 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CiitaP79621 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CiitaP79621 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CiitaP79621 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CiitaP79621 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CiitaP79621 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CiitaP79621 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CiitaP79621 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CiitaP79621 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CiitaP79621 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CiitaP79621 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CiitaP79621 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CiitaP79621 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CiitaP79621 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CiitaP79621 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.1 ms