Protein–RNA interactions for Protein: P68500

Cntn5, Contactin-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn5P68500 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cntn5P68500 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cntn5P68500 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cntn5P68500 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cntn5P68500 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cntn5P68500 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cntn5P68500 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cntn5P68500 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cntn5P68500 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cntn5P68500 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cntn5P68500 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cntn5P68500 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cntn5P68500 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cntn5P68500 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cntn5P68500 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cntn5P68500 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cntn5P68500 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cntn5P68500 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cntn5P68500 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cntn5P68500 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cntn5P68500 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cntn5P68500 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cntn5P68500 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cntn5P68500 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cntn5P68500 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cntn5P68500 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cntn5P68500 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cntn5P68500 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cntn5P68500 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cntn5P68500 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cntn5P68500 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cntn5P68500 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cntn5P68500 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cntn5P68500 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cntn5P68500 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cntn5P68500 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cntn5P68500 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cntn5P68500 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cntn5P68500 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cntn5P68500 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cntn5P68500 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cntn5P68500 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cntn5P68500 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cntn5P68500 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cntn5P68500 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cntn5P68500 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cntn5P68500 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cntn5P68500 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cntn5P68500 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cntn5P68500 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cntn5P68500 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cntn5P68500 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cntn5P68500 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cntn5P68500 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cntn5P68500 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cntn5P68500 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cntn5P68500 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cntn5P68500 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cntn5P68500 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cntn5P68500 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cntn5P68500 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cntn5P68500 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cntn5P68500 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cntn5P68500 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cntn5P68500 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cntn5P68500 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cntn5P68500 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cntn5P68500 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cntn5P68500 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cntn5P68500 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cntn5P68500 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cntn5P68500 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cntn5P68500 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cntn5P68500 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cntn5P68500 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cntn5P68500 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cntn5P68500 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cntn5P68500 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cntn5P68500 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Cntn5P68500 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cntn5P68500 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cntn5P68500 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cntn5P68500 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cntn5P68500 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cntn5P68500 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cntn5P68500 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cntn5P68500 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cntn5P68500 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cntn5P68500 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Cntn5P68500 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cntn5P68500 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cntn5P68500 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cntn5P68500 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cntn5P68500 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cntn5P68500 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cntn5P68500 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cntn5P68500 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cntn5P68500 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cntn5P68500 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cntn5P68500 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.6 ms