Protein–RNA interactions for Protein: P63089

Ptn, Pleiotrophin, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtnP63089 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtnP63089 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtnP63089 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtnP63089 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtnP63089 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtnP63089 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtnP63089 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtnP63089 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtnP63089 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtnP63089 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PtnP63089 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtnP63089 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtnP63089 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtnP63089 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtnP63089 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtnP63089 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtnP63089 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtnP63089 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtnP63089 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtnP63089 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtnP63089 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtnP63089 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtnP63089 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtnP63089 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtnP63089 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtnP63089 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtnP63089 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtnP63089 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtnP63089 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtnP63089 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtnP63089 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtnP63089 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtnP63089 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtnP63089 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtnP63089 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtnP63089 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtnP63089 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PtnP63089 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PtnP63089 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PtnP63089 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PtnP63089 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtnP63089 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtnP63089 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PtnP63089 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtnP63089 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtnP63089 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtnP63089 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtnP63089 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtnP63089 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PtnP63089 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtnP63089 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtnP63089 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtnP63089 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtnP63089 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtnP63089 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtnP63089 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtnP63089 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtnP63089 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtnP63089 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtnP63089 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtnP63089 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtnP63089 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtnP63089 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtnP63089 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtnP63089 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PtnP63089 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtnP63089 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtnP63089 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtnP63089 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtnP63089 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtnP63089 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtnP63089 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtnP63089 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtnP63089 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtnP63089 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtnP63089 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtnP63089 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtnP63089 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtnP63089 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtnP63089 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtnP63089 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtnP63089 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtnP63089 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtnP63089 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtnP63089 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtnP63089 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtnP63089 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtnP63089 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtnP63089 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtnP63089 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtnP63089 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtnP63089 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtnP63089 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PtnP63089 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtnP63089 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtnP63089 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtnP63089 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtnP63089 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtnP63089 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtnP63089 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms