Protein–RNA interactions for Protein: P61080

Ube2d1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d1P61080 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2d1P61080 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2d1P61080 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2d1P61080 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2d1P61080 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2d1P61080 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2d1P61080 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2d1P61080 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2d1P61080 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2d1P61080 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2d1P61080 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2d1P61080 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2d1P61080 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2d1P61080 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2d1P61080 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2d1P61080 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Ube2d1P61080 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2d1P61080 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2d1P61080 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2d1P61080 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2d1P61080 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2d1P61080 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2d1P61080 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2d1P61080 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2d1P61080 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2d1P61080 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2d1P61080 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2d1P61080 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2d1P61080 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2d1P61080 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2d1P61080 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2d1P61080 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2d1P61080 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2d1P61080 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2d1P61080 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2d1P61080 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2d1P61080 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2d1P61080 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2d1P61080 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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