Protein–RNA interactions for Protein: P59997

Kdm2a, Lysine-specific demethylase 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm2aP59997 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Kdm2aP59997 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Kdm2aP59997 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Kdm2aP59997 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Kdm2aP59997 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Kdm2aP59997 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Kdm2aP59997 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Kdm2aP59997 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Kdm2aP59997 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Kdm2aP59997 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Kdm2aP59997 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Kdm2aP59997 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Kdm2aP59997 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Kdm2aP59997 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Kdm2aP59997 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Kdm2aP59997 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Kdm2aP59997 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Kdm2aP59997 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Kdm2aP59997 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Kdm2aP59997 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Kdm2aP59997 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Kdm2aP59997 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Kdm2aP59997 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Kdm2aP59997 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Kdm2aP59997 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Kdm2aP59997 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Kdm2aP59997 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Kdm2aP59997 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Kdm2aP59997 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Kdm2aP59997 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Kdm2aP59997 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Kdm2aP59997 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Kdm2aP59997 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Kdm2aP59997 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Kdm2aP59997 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Kdm2aP59997 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Kdm2aP59997 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Kdm2aP59997 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Kdm2aP59997 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Kdm2aP59997 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Kdm2aP59997 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Kdm2aP59997 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Kdm2aP59997 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Kdm2aP59997 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Kdm2aP59997 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Kdm2aP59997 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Kdm2aP59997 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Kdm2aP59997 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Kdm2aP59997 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Kdm2aP59997 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Kdm2aP59997 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Kdm2aP59997 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Kdm2aP59997 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Kdm2aP59997 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Kdm2aP59997 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Kdm2aP59997 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Kdm2aP59997 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Kdm2aP59997 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Kdm2aP59997 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Kdm2aP59997 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Kdm2aP59997 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Kdm2aP59997 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Kdm2aP59997 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Kdm2aP59997 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Kdm2aP59997 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Kdm2aP59997 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Kdm2aP59997 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Kdm2aP59997 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Kdm2aP59997 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Kdm2aP59997 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Kdm2aP59997 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Kdm2aP59997 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Kdm2aP59997 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Kdm2aP59997 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Kdm2aP59997 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Kdm2aP59997 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Kdm2aP59997 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Kdm2aP59997 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Kdm2aP59997 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Kdm2aP59997 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Kdm2aP59997 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Kdm2aP59997 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Kdm2aP59997 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Kdm2aP59997 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Kdm2aP59997 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Kdm2aP59997 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Kdm2aP59997 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Kdm2aP59997 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Kdm2aP59997 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Kdm2aP59997 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Kdm2aP59997 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Kdm2aP59997 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Kdm2aP59997 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Kdm2aP59997 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Kdm2aP59997 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Kdm2aP59997 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Kdm2aP59997 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Kdm2aP59997 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Kdm2aP59997 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Kdm2aP59997 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms