Protein–RNA interactions for Protein: P59900

Emilin3, EMILIN-3, mousemouse

Predictions only

Length 758 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emilin3P59900 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Emilin3P59900 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Emilin3P59900 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Emilin3P59900 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Emilin3P59900 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Emilin3P59900 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Emilin3P59900 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Emilin3P59900 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Emilin3P59900 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Emilin3P59900 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Emilin3P59900 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Emilin3P59900 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Emilin3P59900 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Emilin3P59900 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Emilin3P59900 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Emilin3P59900 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Emilin3P59900 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Emilin3P59900 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Emilin3P59900 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Emilin3P59900 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Emilin3P59900 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Emilin3P59900 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Emilin3P59900 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Emilin3P59900 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Emilin3P59900 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Emilin3P59900 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Emilin3P59900 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Emilin3P59900 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Emilin3P59900 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Emilin3P59900 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Emilin3P59900 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Emilin3P59900 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Emilin3P59900 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Emilin3P59900 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Emilin3P59900 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Emilin3P59900 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Emilin3P59900 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Emilin3P59900 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Emilin3P59900 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Emilin3P59900 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Emilin3P59900 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Emilin3P59900 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Emilin3P59900 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Emilin3P59900 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Emilin3P59900 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Emilin3P59900 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Emilin3P59900 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Emilin3P59900 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Emilin3P59900 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Emilin3P59900 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Emilin3P59900 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Emilin3P59900 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Emilin3P59900 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Emilin3P59900 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Emilin3P59900 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Emilin3P59900 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Emilin3P59900 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Emilin3P59900 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Emilin3P59900 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Emilin3P59900 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Emilin3P59900 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Emilin3P59900 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Emilin3P59900 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Emilin3P59900 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Emilin3P59900 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Emilin3P59900 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Emilin3P59900 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Emilin3P59900 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Emilin3P59900 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Emilin3P59900 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Emilin3P59900 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Emilin3P59900 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Emilin3P59900 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Emilin3P59900 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Emilin3P59900 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Emilin3P59900 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Emilin3P59900 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Emilin3P59900 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Emilin3P59900 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Emilin3P59900 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Emilin3P59900 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Emilin3P59900 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Emilin3P59900 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Emilin3P59900 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Emilin3P59900 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Emilin3P59900 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Emilin3P59900 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Emilin3P59900 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Emilin3P59900 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Emilin3P59900 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Emilin3P59900 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Emilin3P59900 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Emilin3P59900 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Emilin3P59900 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Emilin3P59900 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Emilin3P59900 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Emilin3P59900 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Emilin3P59900 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Emilin3P59900 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Emilin3P59900 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms