Protein–RNA interactions for Protein: P58854

Tubgcp3, Gamma-tubulin complex component 3, mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp3P58854 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tubgcp3P58854 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tubgcp3P58854 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tubgcp3P58854 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tubgcp3P58854 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tubgcp3P58854 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tubgcp3P58854 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tubgcp3P58854 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tubgcp3P58854 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tubgcp3P58854 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tubgcp3P58854 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubgcp3P58854 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubgcp3P58854 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubgcp3P58854 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubgcp3P58854 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubgcp3P58854 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubgcp3P58854 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tubgcp3P58854 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tubgcp3P58854 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tubgcp3P58854 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tubgcp3P58854 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tubgcp3P58854 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tubgcp3P58854 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tubgcp3P58854 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tubgcp3P58854 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tubgcp3P58854 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tubgcp3P58854 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tubgcp3P58854 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tubgcp3P58854 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tubgcp3P58854 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tubgcp3P58854 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tubgcp3P58854 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tubgcp3P58854 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tubgcp3P58854 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tubgcp3P58854 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tubgcp3P58854 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tubgcp3P58854 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tubgcp3P58854 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tubgcp3P58854 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tubgcp3P58854 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tubgcp3P58854 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tubgcp3P58854 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tubgcp3P58854 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tubgcp3P58854 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tubgcp3P58854 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tubgcp3P58854 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tubgcp3P58854 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tubgcp3P58854 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tubgcp3P58854 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tubgcp3P58854 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tubgcp3P58854 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tubgcp3P58854 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tubgcp3P58854 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tubgcp3P58854 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tubgcp3P58854 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubgcp3P58854 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubgcp3P58854 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubgcp3P58854 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubgcp3P58854 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubgcp3P58854 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubgcp3P58854 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubgcp3P58854 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubgcp3P58854 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubgcp3P58854 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubgcp3P58854 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubgcp3P58854 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubgcp3P58854 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubgcp3P58854 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubgcp3P58854 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubgcp3P58854 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubgcp3P58854 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubgcp3P58854 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubgcp3P58854 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubgcp3P58854 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubgcp3P58854 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubgcp3P58854 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubgcp3P58854 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubgcp3P58854 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubgcp3P58854 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubgcp3P58854 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubgcp3P58854 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubgcp3P58854 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubgcp3P58854 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubgcp3P58854 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubgcp3P58854 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubgcp3P58854 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubgcp3P58854 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubgcp3P58854 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubgcp3P58854 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubgcp3P58854 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubgcp3P58854 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubgcp3P58854 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubgcp3P58854 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubgcp3P58854 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubgcp3P58854 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubgcp3P58854 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubgcp3P58854 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubgcp3P58854 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubgcp3P58854 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubgcp3P58854 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms