Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Samsn1P57725 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Samsn1P57725 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Samsn1P57725 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Samsn1P57725 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Samsn1P57725 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Samsn1P57725 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Samsn1P57725 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Samsn1P57725 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Samsn1P57725 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Samsn1P57725 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Samsn1P57725 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Samsn1P57725 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Samsn1P57725 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Samsn1P57725 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Samsn1P57725 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Samsn1P57725 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Samsn1P57725 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Samsn1P57725 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Samsn1P57725 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Samsn1P57725 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Samsn1P57725 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Samsn1P57725 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Samsn1P57725 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Samsn1P57725 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Samsn1P57725 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Samsn1P57725 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Samsn1P57725 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Samsn1P57725 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Samsn1P57725 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Samsn1P57725 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Samsn1P57725 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Samsn1P57725 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Samsn1P57725 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Samsn1P57725 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Samsn1P57725 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Samsn1P57725 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Samsn1P57725 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Samsn1P57725 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Samsn1P57725 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Samsn1P57725 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Samsn1P57725 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Samsn1P57725 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Samsn1P57725 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Samsn1P57725 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Samsn1P57725 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Samsn1P57725 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Samsn1P57725 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Samsn1P57725 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Samsn1P57725 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Samsn1P57725 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Samsn1P57725 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Samsn1P57725 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Samsn1P57725 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Samsn1P57725 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Samsn1P57725 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Samsn1P57725 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Samsn1P57725 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Samsn1P57725 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Samsn1P57725 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Samsn1P57725 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Samsn1P57725 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Samsn1P57725 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Samsn1P57725 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Samsn1P57725 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Samsn1P57725 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Samsn1P57725 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Samsn1P57725 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Samsn1P57725 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Samsn1P57725 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Samsn1P57725 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Samsn1P57725 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Samsn1P57725 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Samsn1P57725 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Samsn1P57725 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Samsn1P57725 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Samsn1P57725 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Samsn1P57725 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Samsn1P57725 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Samsn1P57725 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Samsn1P57725 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Samsn1P57725 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Samsn1P57725 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Samsn1P57725 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Samsn1P57725 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Samsn1P57725 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Samsn1P57725 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Samsn1P57725 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Samsn1P57725 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Samsn1P57725 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Samsn1P57725 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Samsn1P57725 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Samsn1P57725 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Samsn1P57725 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Samsn1P57725 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Samsn1P57725 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Samsn1P57725 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Samsn1P57725 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Samsn1P57725 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Samsn1P57725 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms