Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rrp1P56183 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rrp1P56183 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rrp1P56183 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rrp1P56183 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rrp1P56183 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rrp1P56183 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rrp1P56183 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rrp1P56183 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rrp1P56183 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rrp1P56183 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rrp1P56183 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Rrp1P56183 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rrp1P56183 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rrp1P56183 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rrp1P56183 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rrp1P56183 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rrp1P56183 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rrp1P56183 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rrp1P56183 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rrp1P56183 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rrp1P56183 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rrp1P56183 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rrp1P56183 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rrp1P56183 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Rrp1P56183 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Rrp1P56183 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rrp1P56183 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rrp1P56183 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rrp1P56183 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rrp1P56183 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rrp1P56183 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rrp1P56183 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rrp1P56183 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rrp1P56183 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rrp1P56183 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rrp1P56183 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rrp1P56183 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Rrp1P56183 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rrp1P56183 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Rrp1P56183 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rrp1P56183 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rrp1P56183 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rrp1P56183 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rrp1P56183 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rrp1P56183 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rrp1P56183 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rrp1P56183 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rrp1P56183 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rrp1P56183 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rrp1P56183 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rrp1P56183 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rrp1P56183 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rrp1P56183 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rrp1P56183 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rrp1P56183 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rrp1P56183 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rrp1P56183 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rrp1P56183 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rrp1P56183 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rrp1P56183 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rrp1P56183 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rrp1P56183 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rrp1P56183 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rrp1P56183 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rrp1P56183 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Rrp1P56183 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rrp1P56183 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rrp1P56183 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rrp1P56183 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rrp1P56183 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rrp1P56183 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rrp1P56183 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rrp1P56183 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rrp1P56183 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rrp1P56183 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rrp1P56183 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rrp1P56183 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rrp1P56183 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rrp1P56183 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rrp1P56183 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rrp1P56183 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rrp1P56183 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rrp1P56183 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rrp1P56183 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rrp1P56183 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rrp1P56183 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rrp1P56183 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rrp1P56183 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rrp1P56183 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Rrp1P56183 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rrp1P56183 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rrp1P56183 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rrp1P56183 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rrp1P56183 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rrp1P56183 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rrp1P56183 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rrp1P56183 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rrp1P56183 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rrp1P56183 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms