Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Upp1P52624 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Upp1P52624 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Upp1P52624 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Upp1P52624 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Upp1P52624 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Upp1P52624 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Upp1P52624 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Upp1P52624 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Upp1P52624 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Upp1P52624 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Upp1P52624 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Upp1P52624 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Upp1P52624 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Upp1P52624 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Upp1P52624 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Upp1P52624 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Upp1P52624 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Upp1P52624 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Upp1P52624 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Upp1P52624 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Upp1P52624 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Upp1P52624 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Upp1P52624 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Upp1P52624 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Upp1P52624 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Upp1P52624 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Upp1P52624 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Upp1P52624 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Upp1P52624 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Upp1P52624 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Upp1P52624 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Upp1P52624 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Upp1P52624 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Upp1P52624 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Upp1P52624 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Upp1P52624 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Upp1P52624 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Upp1P52624 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Upp1P52624 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Upp1P52624 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Upp1P52624 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Upp1P52624 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Upp1P52624 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Upp1P52624 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Upp1P52624 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Upp1P52624 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Upp1P52624 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Upp1P52624 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Upp1P52624 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Upp1P52624 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Upp1P52624 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Upp1P52624 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Upp1P52624 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Upp1P52624 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Upp1P52624 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Upp1P52624 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Upp1P52624 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Upp1P52624 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Upp1P52624 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Upp1P52624 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Upp1P52624 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Upp1P52624 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Upp1P52624 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Upp1P52624 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Upp1P52624 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Upp1P52624 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Upp1P52624 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Upp1P52624 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Upp1P52624 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Upp1P52624 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Upp1P52624 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Upp1P52624 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Upp1P52624 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Upp1P52624 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Upp1P52624 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Upp1P52624 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Upp1P52624 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Upp1P52624 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Upp1P52624 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Upp1P52624 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Upp1P52624 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Upp1P52624 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Upp1P52624 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Upp1P52624 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Upp1P52624 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Upp1P52624 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Upp1P52624 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Upp1P52624 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Upp1P52624 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Upp1P52624 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Upp1P52624 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Upp1P52624 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Upp1P52624 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Upp1P52624 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Upp1P52624 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Upp1P52624 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Upp1P52624 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Upp1P52624 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Upp1P52624 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms