Protein–RNA interactions for Protein: P51859

Hdgf, Hepatoma-derived growth factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HdgfP51859 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HdgfP51859 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HdgfP51859 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HdgfP51859 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HdgfP51859 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28■■■□□ 2.07
HdgfP51859 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HdgfP51859 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
HdgfP51859 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC28■■■□□ 2.07
HdgfP51859 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HdgfP51859 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
HdgfP51859 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HdgfP51859 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HdgfP51859 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HdgfP51859 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HdgfP51859 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
HdgfP51859 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
HdgfP51859 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HdgfP51859 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HdgfP51859 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HdgfP51859 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HdgfP51859 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HdgfP51859 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
HdgfP51859 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
HdgfP51859 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HdgfP51859 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HdgfP51859 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HdgfP51859 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HdgfP51859 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HdgfP51859 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HdgfP51859 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
HdgfP51859 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HdgfP51859 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HdgfP51859 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HdgfP51859 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HdgfP51859 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
HdgfP51859 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HdgfP51859 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HdgfP51859 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HdgfP51859 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HdgfP51859 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HdgfP51859 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HdgfP51859 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HdgfP51859 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HdgfP51859 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HdgfP51859 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HdgfP51859 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HdgfP51859 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HdgfP51859 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
HdgfP51859 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HdgfP51859 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HdgfP51859 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HdgfP51859 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HdgfP51859 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HdgfP51859 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HdgfP51859 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HdgfP51859 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HdgfP51859 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HdgfP51859 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HdgfP51859 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HdgfP51859 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HdgfP51859 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HdgfP51859 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HdgfP51859 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HdgfP51859 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HdgfP51859 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HdgfP51859 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
HdgfP51859 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
HdgfP51859 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
HdgfP51859 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HdgfP51859 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HdgfP51859 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HdgfP51859 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HdgfP51859 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HdgfP51859 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HdgfP51859 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HdgfP51859 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HdgfP51859 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
HdgfP51859 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HdgfP51859 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
HdgfP51859 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HdgfP51859 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HdgfP51859 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HdgfP51859 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
HdgfP51859 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HdgfP51859 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HdgfP51859 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HdgfP51859 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HdgfP51859 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HdgfP51859 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
HdgfP51859 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HdgfP51859 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HdgfP51859 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HdgfP51859 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HdgfP51859 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HdgfP51859 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HdgfP51859 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HdgfP51859 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HdgfP51859 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HdgfP51859 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HdgfP51859 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 188.9 ms