Protein–RNA interactions for Protein: P48318

Gad1, Glutamate decarboxylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gad1P48318 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gad1P48318 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gad1P48318 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gad1P48318 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gad1P48318 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gad1P48318 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gad1P48318 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gad1P48318 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gad1P48318 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gad1P48318 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gad1P48318 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gad1P48318 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gad1P48318 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gad1P48318 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gad1P48318 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gad1P48318 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gad1P48318 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gad1P48318 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gad1P48318 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gad1P48318 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gad1P48318 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Gad1P48318 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Gad1P48318 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gad1P48318 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gad1P48318 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gad1P48318 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gad1P48318 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gad1P48318 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Gad1P48318 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Gad1P48318 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gad1P48318 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gad1P48318 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Gad1P48318 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gad1P48318 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gad1P48318 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gad1P48318 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gad1P48318 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gad1P48318 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gad1P48318 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gad1P48318 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gad1P48318 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gad1P48318 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gad1P48318 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gad1P48318 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gad1P48318 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gad1P48318 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gad1P48318 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gad1P48318 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gad1P48318 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gad1P48318 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gad1P48318 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gad1P48318 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gad1P48318 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gad1P48318 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gad1P48318 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gad1P48318 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gad1P48318 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gad1P48318 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gad1P48318 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gad1P48318 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gad1P48318 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gad1P48318 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gad1P48318 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gad1P48318 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gad1P48318 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gad1P48318 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gad1P48318 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gad1P48318 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gad1P48318 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gad1P48318 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gad1P48318 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gad1P48318 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gad1P48318 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gad1P48318 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gad1P48318 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gad1P48318 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gad1P48318 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gad1P48318 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gad1P48318 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gad1P48318 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gad1P48318 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gad1P48318 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gad1P48318 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gad1P48318 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gad1P48318 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gad1P48318 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gad1P48318 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gad1P48318 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gad1P48318 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gad1P48318 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gad1P48318 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gad1P48318 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gad1P48318 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gad1P48318 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gad1P48318 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gad1P48318 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gad1P48318 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gad1P48318 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gad1P48318 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gad1P48318 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms