Protein–RNA interactions for Protein: P46737

Brcc3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brcc3P46737 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brcc3P46737 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brcc3P46737 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brcc3P46737 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brcc3P46737 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brcc3P46737 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brcc3P46737 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brcc3P46737 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brcc3P46737 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Brcc3P46737 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brcc3P46737 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brcc3P46737 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brcc3P46737 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brcc3P46737 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brcc3P46737 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brcc3P46737 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brcc3P46737 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brcc3P46737 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brcc3P46737 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brcc3P46737 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brcc3P46737 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brcc3P46737 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brcc3P46737 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brcc3P46737 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brcc3P46737 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brcc3P46737 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brcc3P46737 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Brcc3P46737 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brcc3P46737 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brcc3P46737 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brcc3P46737 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brcc3P46737 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brcc3P46737 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brcc3P46737 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brcc3P46737 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Brcc3P46737 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brcc3P46737 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brcc3P46737 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brcc3P46737 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brcc3P46737 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brcc3P46737 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brcc3P46737 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brcc3P46737 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brcc3P46737 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brcc3P46737 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brcc3P46737 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brcc3P46737 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Brcc3P46737 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Brcc3P46737 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brcc3P46737 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brcc3P46737 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brcc3P46737 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brcc3P46737 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brcc3P46737 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brcc3P46737 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brcc3P46737 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brcc3P46737 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brcc3P46737 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brcc3P46737 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brcc3P46737 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brcc3P46737 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brcc3P46737 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brcc3P46737 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brcc3P46737 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brcc3P46737 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brcc3P46737 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brcc3P46737 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brcc3P46737 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brcc3P46737 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brcc3P46737 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brcc3P46737 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brcc3P46737 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brcc3P46737 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brcc3P46737 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brcc3P46737 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brcc3P46737 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Brcc3P46737 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brcc3P46737 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brcc3P46737 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brcc3P46737 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brcc3P46737 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brcc3P46737 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brcc3P46737 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brcc3P46737 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brcc3P46737 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brcc3P46737 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brcc3P46737 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brcc3P46737 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brcc3P46737 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brcc3P46737 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brcc3P46737 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brcc3P46737 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Brcc3P46737 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Brcc3P46737 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brcc3P46737 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Brcc3P46737 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brcc3P46737 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brcc3P46737 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brcc3P46737 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brcc3P46737 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms