Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdkn1bP46414 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdkn1bP46414 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdkn1bP46414 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdkn1bP46414 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdkn1bP46414 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdkn1bP46414 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdkn1bP46414 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdkn1bP46414 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdkn1bP46414 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdkn1bP46414 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdkn1bP46414 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdkn1bP46414 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdkn1bP46414 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdkn1bP46414 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdkn1bP46414 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdkn1bP46414 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdkn1bP46414 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdkn1bP46414 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdkn1bP46414 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdkn1bP46414 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdkn1bP46414 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdkn1bP46414 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdkn1bP46414 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdkn1bP46414 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdkn1bP46414 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdkn1bP46414 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdkn1bP46414 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdkn1bP46414 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdkn1bP46414 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdkn1bP46414 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdkn1bP46414 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdkn1bP46414 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdkn1bP46414 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdkn1bP46414 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cdkn1bP46414 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Cdkn1bP46414 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdkn1bP46414 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdkn1bP46414 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdkn1bP46414 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdkn1bP46414 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdkn1bP46414 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdkn1bP46414 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdkn1bP46414 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdkn1bP46414 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkn1bP46414 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkn1bP46414 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkn1bP46414 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkn1bP46414 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkn1bP46414 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkn1bP46414 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkn1bP46414 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdkn1bP46414 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdkn1bP46414 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdkn1bP46414 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdkn1bP46414 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdkn1bP46414 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdkn1bP46414 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdkn1bP46414 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdkn1bP46414 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdkn1bP46414 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdkn1bP46414 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdkn1bP46414 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdkn1bP46414 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdkn1bP46414 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdkn1bP46414 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdkn1bP46414 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdkn1bP46414 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdkn1bP46414 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdkn1bP46414 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdkn1bP46414 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdkn1bP46414 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdkn1bP46414 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdkn1bP46414 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdkn1bP46414 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdkn1bP46414 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdkn1bP46414 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdkn1bP46414 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdkn1bP46414 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdkn1bP46414 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdkn1bP46414 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdkn1bP46414 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdkn1bP46414 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdkn1bP46414 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdkn1bP46414 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cdkn1bP46414 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdkn1bP46414 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdkn1bP46414 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdkn1bP46414 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdkn1bP46414 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdkn1bP46414 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdkn1bP46414 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdkn1bP46414 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdkn1bP46414 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdkn1bP46414 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdkn1bP46414 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdkn1bP46414 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdkn1bP46414 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdkn1bP46414 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdkn1bP46414 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms