Protein–RNA interactions for Protein: P42582

Nkx2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-5P42582 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nkx2-5P42582 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nkx2-5P42582 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nkx2-5P42582 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nkx2-5P42582 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nkx2-5P42582 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nkx2-5P42582 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nkx2-5P42582 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nkx2-5P42582 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nkx2-5P42582 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nkx2-5P42582 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nkx2-5P42582 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nkx2-5P42582 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nkx2-5P42582 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nkx2-5P42582 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nkx2-5P42582 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nkx2-5P42582 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nkx2-5P42582 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nkx2-5P42582 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nkx2-5P42582 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nkx2-5P42582 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nkx2-5P42582 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nkx2-5P42582 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nkx2-5P42582 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nkx2-5P42582 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nkx2-5P42582 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nkx2-5P42582 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Nkx2-5P42582 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nkx2-5P42582 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nkx2-5P42582 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nkx2-5P42582 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nkx2-5P42582 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nkx2-5P42582 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nkx2-5P42582 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nkx2-5P42582 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nkx2-5P42582 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nkx2-5P42582 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nkx2-5P42582 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nkx2-5P42582 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nkx2-5P42582 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Nkx2-5P42582 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nkx2-5P42582 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nkx2-5P42582 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nkx2-5P42582 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nkx2-5P42582 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nkx2-5P42582 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkx2-5P42582 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkx2-5P42582 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkx2-5P42582 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkx2-5P42582 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkx2-5P42582 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkx2-5P42582 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkx2-5P42582 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkx2-5P42582 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkx2-5P42582 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nkx2-5P42582 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nkx2-5P42582 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nkx2-5P42582 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nkx2-5P42582 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Nkx2-5P42582 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nkx2-5P42582 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nkx2-5P42582 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nkx2-5P42582 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nkx2-5P42582 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nkx2-5P42582 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Nkx2-5P42582 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nkx2-5P42582 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nkx2-5P42582 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nkx2-5P42582 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nkx2-5P42582 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nkx2-5P42582 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nkx2-5P42582 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nkx2-5P42582 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nkx2-5P42582 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nkx2-5P42582 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Nkx2-5P42582 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nkx2-5P42582 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nkx2-5P42582 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nkx2-5P42582 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nkx2-5P42582 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nkx2-5P42582 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nkx2-5P42582 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nkx2-5P42582 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nkx2-5P42582 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nkx2-5P42582 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nkx2-5P42582 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nkx2-5P42582 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nkx2-5P42582 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nkx2-5P42582 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nkx2-5P42582 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nkx2-5P42582 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nkx2-5P42582 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nkx2-5P42582 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nkx2-5P42582 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nkx2-5P42582 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nkx2-5P42582 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Nkx2-5P42582 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nkx2-5P42582 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nkx2-5P42582 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nkx2-5P42582 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 160.3 ms