Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Chd1P40201 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
Chd1P40201 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
Chd1P40201 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
Chd1P40201 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Chd1P40201 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Chd1P40201 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Chd1P40201 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Chd1P40201 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
Chd1P40201 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Chd1P40201 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Chd1P40201 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Chd1P40201 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
Chd1P40201 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Chd1P40201 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Chd1P40201 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Chd1P40201 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
Chd1P40201 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Chd1P40201 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Chd1P40201 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Chd1P40201 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Chd1P40201 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Chd1P40201 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Chd1P40201 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Chd1P40201 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Chd1P40201 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Chd1P40201 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Chd1P40201 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Chd1P40201 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Chd1P40201 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Chd1P40201 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Chd1P40201 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Chd1P40201 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Chd1P40201 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Chd1P40201 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Chd1P40201 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Chd1P40201 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Chd1P40201 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Chd1P40201 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Chd1P40201 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Chd1P40201 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Chd1P40201 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Chd1P40201 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Chd1P40201 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Chd1P40201 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Chd1P40201 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Chd1P40201 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Chd1P40201 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Chd1P40201 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Chd1P40201 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Chd1P40201 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Chd1P40201 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Chd1P40201 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Chd1P40201 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Chd1P40201 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Chd1P40201 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Chd1P40201 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Chd1P40201 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Chd1P40201 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Chd1P40201 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Chd1P40201 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Chd1P40201 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Chd1P40201 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
Chd1P40201 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Chd1P40201 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Chd1P40201 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Chd1P40201 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Chd1P40201 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Chd1P40201 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Chd1P40201 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Chd1P40201 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Chd1P40201 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Chd1P40201 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Chd1P40201 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Chd1P40201 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Chd1P40201 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Chd1P40201 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Chd1P40201 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Chd1P40201 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
Chd1P40201 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Chd1P40201 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Chd1P40201 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Chd1P40201 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Chd1P40201 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Chd1P40201 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Chd1P40201 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Chd1P40201 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Chd1P40201 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Chd1P40201 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Chd1P40201 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
Chd1P40201 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Chd1P40201 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
Chd1P40201 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Chd1P40201 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
Chd1P40201 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Chd1P40201 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Chd1P40201 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Chd1P40201 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Chd1P40201 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Chd1P40201 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.9 ms