Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PpardP35396 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PpardP35396 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PpardP35396 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PpardP35396 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PpardP35396 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PpardP35396 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PpardP35396 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PpardP35396 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PpardP35396 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PpardP35396 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PpardP35396 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PpardP35396 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PpardP35396 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PpardP35396 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PpardP35396 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PpardP35396 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PpardP35396 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PpardP35396 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PpardP35396 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PpardP35396 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PpardP35396 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PpardP35396 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PpardP35396 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PpardP35396 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PpardP35396 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PpardP35396 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PpardP35396 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PpardP35396 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PpardP35396 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PpardP35396 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PpardP35396 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PpardP35396 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PpardP35396 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PpardP35396 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PpardP35396 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PpardP35396 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PpardP35396 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PpardP35396 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PpardP35396 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PpardP35396 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PpardP35396 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PpardP35396 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PpardP35396 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PpardP35396 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PpardP35396 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PpardP35396 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PpardP35396 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PpardP35396 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PpardP35396 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PpardP35396 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PpardP35396 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PpardP35396 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PpardP35396 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PpardP35396 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PpardP35396 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PpardP35396 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PpardP35396 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PpardP35396 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PpardP35396 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PpardP35396 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PpardP35396 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PpardP35396 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PpardP35396 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PpardP35396 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PpardP35396 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PpardP35396 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PpardP35396 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PpardP35396 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PpardP35396 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PpardP35396 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PpardP35396 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PpardP35396 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PpardP35396 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PpardP35396 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PpardP35396 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PpardP35396 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PpardP35396 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PpardP35396 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PpardP35396 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PpardP35396 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PpardP35396 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PpardP35396 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PpardP35396 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PpardP35396 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PpardP35396 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PpardP35396 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PpardP35396 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PpardP35396 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PpardP35396 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PpardP35396 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PpardP35396 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PpardP35396 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PpardP35396 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PpardP35396 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PpardP35396 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PpardP35396 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PpardP35396 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PpardP35396 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PpardP35396 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 143.7 ms