Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab20P35295 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab20P35295 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab20P35295 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab20P35295 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab20P35295 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab20P35295 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab20P35295 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab20P35295 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rab20P35295 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rab20P35295 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rab20P35295 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rab20P35295 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rab20P35295 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rab20P35295 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rab20P35295 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab20P35295 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab20P35295 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab20P35295 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab20P35295 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab20P35295 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab20P35295 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab20P35295 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab20P35295 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab20P35295 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab20P35295 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rab20P35295 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rab20P35295 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rab20P35295 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rab20P35295 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rab20P35295 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Rab20P35295 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab20P35295 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab20P35295 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab20P35295 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab20P35295 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab20P35295 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab20P35295 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab20P35295 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rab20P35295 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rab20P35295 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rab20P35295 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rab20P35295 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rab20P35295 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rab20P35295 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rab20P35295 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rab20P35295 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rab20P35295 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rab20P35295 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rab20P35295 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Rab20P35295 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rab20P35295 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rab20P35295 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rab20P35295 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rab20P35295 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rab20P35295 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rab20P35295 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rab20P35295 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rab20P35295 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rab20P35295 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rab20P35295 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rab20P35295 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rab20P35295 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rab20P35295 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rab20P35295 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rab20P35295 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rab20P35295 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Rab20P35295 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rab20P35295 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rab20P35295 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rab20P35295 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rab20P35295 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rab20P35295 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rab20P35295 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Rab20P35295 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rab20P35295 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Rab20P35295 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rab20P35295 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rab20P35295 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Rab20P35295 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rab20P35295 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rab20P35295 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rab20P35295 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rab20P35295 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rab20P35295 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rab20P35295 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rab20P35295 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rab20P35295 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rab20P35295 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rab20P35295 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rab20P35295 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rab20P35295 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rab20P35295 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rab20P35295 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rab20P35295 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Rab20P35295 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rab20P35295 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rab20P35295 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rab20P35295 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rab20P35295 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 167.2 ms