Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxc11P31313 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxc11P31313 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxc11P31313 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxc11P31313 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxc11P31313 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxc11P31313 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxc11P31313 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxc11P31313 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxc11P31313 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxc11P31313 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hoxc11P31313 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxc11P31313 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxc11P31313 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxc11P31313 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxc11P31313 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxc11P31313 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxc11P31313 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxc11P31313 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxc11P31313 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxc11P31313 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxc11P31313 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxc11P31313 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxc11P31313 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxc11P31313 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxc11P31313 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxc11P31313 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxc11P31313 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxc11P31313 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxc11P31313 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxc11P31313 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxc11P31313 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxc11P31313 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxc11P31313 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxc11P31313 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxc11P31313 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxc11P31313 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxc11P31313 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxc11P31313 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxc11P31313 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxc11P31313 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxc11P31313 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxc11P31313 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxc11P31313 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxc11P31313 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxc11P31313 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxc11P31313 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxc11P31313 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxc11P31313 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxc11P31313 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxc11P31313 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxc11P31313 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxc11P31313 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxc11P31313 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxc11P31313 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxc11P31313 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxc11P31313 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Hoxc11P31313 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Hoxc11P31313 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Hoxc11P31313 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxc11P31313 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxc11P31313 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxc11P31313 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxc11P31313 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxc11P31313 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxc11P31313 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxc11P31313 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxc11P31313 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxc11P31313 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxc11P31313 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxc11P31313 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxc11P31313 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxc11P31313 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxc11P31313 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxc11P31313 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxc11P31313 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxc11P31313 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxc11P31313 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxc11P31313 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxc11P31313 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxc11P31313 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxc11P31313 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxc11P31313 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxc11P31313 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxc11P31313 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxc11P31313 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxc11P31313 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxc11P31313 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxc11P31313 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxc11P31313 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxc11P31313 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxc11P31313 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxc11P31313 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxc11P31313 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxc11P31313 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxc11P31313 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxc11P31313 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxc11P31313 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxc11P31313 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxc11P31313 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms