Protein–RNA interactions for Protein: P29452

Casp1, Caspase-1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp1P29452 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Casp1P29452 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Casp1P29452 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Casp1P29452 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Casp1P29452 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Casp1P29452 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Casp1P29452 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Casp1P29452 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Casp1P29452 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Casp1P29452 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Casp1P29452 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Casp1P29452 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Casp1P29452 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Casp1P29452 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Casp1P29452 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Casp1P29452 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Casp1P29452 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Casp1P29452 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Casp1P29452 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Casp1P29452 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Casp1P29452 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Casp1P29452 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Casp1P29452 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Casp1P29452 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Casp1P29452 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Casp1P29452 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Casp1P29452 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Casp1P29452 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Casp1P29452 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Casp1P29452 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Casp1P29452 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Casp1P29452 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Casp1P29452 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Casp1P29452 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Casp1P29452 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Casp1P29452 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Casp1P29452 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Casp1P29452 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Casp1P29452 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Casp1P29452 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Casp1P29452 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Casp1P29452 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Casp1P29452 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Casp1P29452 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Casp1P29452 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Casp1P29452 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Casp1P29452 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Casp1P29452 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Casp1P29452 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Casp1P29452 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Casp1P29452 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Casp1P29452 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Casp1P29452 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Casp1P29452 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Casp1P29452 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Casp1P29452 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Casp1P29452 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Casp1P29452 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Casp1P29452 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Casp1P29452 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Casp1P29452 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Casp1P29452 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Casp1P29452 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Casp1P29452 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Casp1P29452 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Casp1P29452 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Casp1P29452 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Casp1P29452 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Casp1P29452 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Casp1P29452 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Casp1P29452 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Casp1P29452 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Casp1P29452 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Casp1P29452 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Casp1P29452 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Casp1P29452 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Casp1P29452 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Casp1P29452 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Casp1P29452 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Casp1P29452 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Casp1P29452 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Casp1P29452 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Casp1P29452 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Casp1P29452 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Casp1P29452 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Casp1P29452 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Casp1P29452 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Casp1P29452 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Casp1P29452 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Casp1P29452 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Casp1P29452 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Casp1P29452 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Casp1P29452 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Casp1P29452 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Casp1P29452 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Casp1P29452 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Casp1P29452 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Casp1P29452 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Casp1P29452 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Casp1P29452 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms