Protein–RNA interactions for Protein: P28661

Sept4, Septin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept4P28661 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sept4P28661 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sept4P28661 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sept4P28661 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Sept4P28661 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sept4P28661 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sept4P28661 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sept4P28661 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sept4P28661 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sept4P28661 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sept4P28661 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sept4P28661 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Sept4P28661 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sept4P28661 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sept4P28661 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sept4P28661 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sept4P28661 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sept4P28661 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sept4P28661 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sept4P28661 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sept4P28661 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sept4P28661 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sept4P28661 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sept4P28661 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sept4P28661 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sept4P28661 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sept4P28661 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sept4P28661 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sept4P28661 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sept4P28661 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sept4P28661 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Sept4P28661 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sept4P28661 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sept4P28661 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sept4P28661 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sept4P28661 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sept4P28661 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Sept4P28661 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sept4P28661 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sept4P28661 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sept4P28661 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sept4P28661 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sept4P28661 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sept4P28661 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sept4P28661 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sept4P28661 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sept4P28661 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sept4P28661 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sept4P28661 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sept4P28661 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sept4P28661 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sept4P28661 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sept4P28661 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sept4P28661 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sept4P28661 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sept4P28661 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sept4P28661 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sept4P28661 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sept4P28661 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sept4P28661 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sept4P28661 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sept4P28661 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sept4P28661 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sept4P28661 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sept4P28661 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sept4P28661 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sept4P28661 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sept4P28661 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sept4P28661 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sept4P28661 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sept4P28661 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sept4P28661 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Sept4P28661 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sept4P28661 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sept4P28661 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sept4P28661 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sept4P28661 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sept4P28661 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sept4P28661 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sept4P28661 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sept4P28661 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sept4P28661 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sept4P28661 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sept4P28661 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sept4P28661 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sept4P28661 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sept4P28661 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sept4P28661 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Sept4P28661 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sept4P28661 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sept4P28661 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sept4P28661 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sept4P28661 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sept4P28661 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sept4P28661 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sept4P28661 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sept4P28661 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sept4P28661 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sept4P28661 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sept4P28661 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms