Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxd12P23812 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxd12P23812 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxd12P23812 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxd12P23812 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxd12P23812 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxd12P23812 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxd12P23812 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxd12P23812 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxd12P23812 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxd12P23812 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxd12P23812 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxd12P23812 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxd12P23812 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxd12P23812 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxd12P23812 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxd12P23812 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxd12P23812 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxd12P23812 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxd12P23812 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxd12P23812 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxd12P23812 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxd12P23812 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxd12P23812 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxd12P23812 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxd12P23812 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hoxd12P23812 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hoxd12P23812 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Hoxd12P23812 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hoxd12P23812 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxd12P23812 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxd12P23812 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxd12P23812 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxd12P23812 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxd12P23812 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxd12P23812 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxd12P23812 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxd12P23812 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxd12P23812 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxd12P23812 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxd12P23812 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxd12P23812 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxd12P23812 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Hoxd12P23812 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxd12P23812 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxd12P23812 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxd12P23812 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxd12P23812 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxd12P23812 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxd12P23812 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxd12P23812 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxd12P23812 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxd12P23812 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxd12P23812 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxd12P23812 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxd12P23812 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxd12P23812 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxd12P23812 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxd12P23812 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxd12P23812 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxd12P23812 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxd12P23812 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxd12P23812 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Hoxd12P23812 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxd12P23812 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxd12P23812 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxd12P23812 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxd12P23812 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Hoxd12P23812 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxd12P23812 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxd12P23812 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxd12P23812 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxd12P23812 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Hoxd12P23812 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxd12P23812 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxd12P23812 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxd12P23812 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Hoxd12P23812 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Hoxd12P23812 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Hoxd12P23812 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxd12P23812 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxd12P23812 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxd12P23812 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxd12P23812 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxd12P23812 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxd12P23812 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxd12P23812 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxd12P23812 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxd12P23812 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxd12P23812 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxd12P23812 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxd12P23812 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxd12P23812 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxd12P23812 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxd12P23812 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxd12P23812 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxd12P23812 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxd12P23812 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxd12P23812 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxd12P23812 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms