Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxd8P23463 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxd8P23463 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxd8P23463 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxd8P23463 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxd8P23463 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxd8P23463 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxd8P23463 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxd8P23463 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxd8P23463 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxd8P23463 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxd8P23463 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxd8P23463 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxd8P23463 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxd8P23463 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxd8P23463 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxd8P23463 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxd8P23463 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxd8P23463 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxd8P23463 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxd8P23463 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hoxd8P23463 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hoxd8P23463 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxd8P23463 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxd8P23463 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxd8P23463 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxd8P23463 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxd8P23463 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxd8P23463 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxd8P23463 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxd8P23463 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxd8P23463 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxd8P23463 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxd8P23463 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxd8P23463 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxd8P23463 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxd8P23463 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxd8P23463 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxd8P23463 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxd8P23463 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxd8P23463 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxd8P23463 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxd8P23463 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxd8P23463 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxd8P23463 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxd8P23463 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxd8P23463 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxd8P23463 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxd8P23463 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxd8P23463 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxd8P23463 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxd8P23463 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxd8P23463 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxd8P23463 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxd8P23463 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxd8P23463 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxd8P23463 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxd8P23463 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxd8P23463 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxd8P23463 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxd8P23463 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxd8P23463 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxd8P23463 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxd8P23463 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxd8P23463 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxd8P23463 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxd8P23463 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Hoxd8P23463 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Hoxd8P23463 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxd8P23463 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxd8P23463 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxd8P23463 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxd8P23463 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxd8P23463 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxd8P23463 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxd8P23463 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Hoxd8P23463 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Hoxd8P23463 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxd8P23463 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxd8P23463 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxd8P23463 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxd8P23463 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxd8P23463 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxd8P23463 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxd8P23463 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxd8P23463 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxd8P23463 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxd8P23463 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxd8P23463 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxd8P23463 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxd8P23463 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxd8P23463 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxd8P23463 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxd8P23463 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxd8P23463 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxd8P23463 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxd8P23463 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxd8P23463 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxd8P23463 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxd8P23463 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms