Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tpm3P21107 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tpm3P21107 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tpm3P21107 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tpm3P21107 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tpm3P21107 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tpm3P21107 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tpm3P21107 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Tpm3P21107 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tpm3P21107 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tpm3P21107 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Tpm3P21107 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tpm3P21107 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tpm3P21107 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tpm3P21107 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tpm3P21107 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Tpm3P21107 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Tpm3P21107 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tpm3P21107 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tpm3P21107 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tpm3P21107 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tpm3P21107 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tpm3P21107 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tpm3P21107 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tpm3P21107 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tpm3P21107 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tpm3P21107 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tpm3P21107 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tpm3P21107 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tpm3P21107 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tpm3P21107 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tpm3P21107 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tpm3P21107 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tpm3P21107 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tpm3P21107 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tpm3P21107 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tpm3P21107 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tpm3P21107 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tpm3P21107 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tpm3P21107 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tpm3P21107 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tpm3P21107 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tpm3P21107 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tpm3P21107 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tpm3P21107 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tpm3P21107 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tpm3P21107 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tpm3P21107 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tpm3P21107 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tpm3P21107 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tpm3P21107 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Tpm3P21107 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tpm3P21107 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tpm3P21107 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tpm3P21107 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tpm3P21107 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tpm3P21107 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tpm3P21107 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tpm3P21107 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tpm3P21107 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tpm3P21107 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tpm3P21107 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tpm3P21107 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tpm3P21107 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tpm3P21107 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tpm3P21107 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tpm3P21107 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tpm3P21107 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tpm3P21107 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tpm3P21107 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tpm3P21107 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tpm3P21107 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tpm3P21107 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tpm3P21107 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tpm3P21107 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tpm3P21107 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tpm3P21107 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Tpm3P21107 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tpm3P21107 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tpm3P21107 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tpm3P21107 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tpm3P21107 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Tpm3P21107 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tpm3P21107 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tpm3P21107 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tpm3P21107 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tpm3P21107 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tpm3P21107 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tpm3P21107 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tpm3P21107 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tpm3P21107 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tpm3P21107 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tpm3P21107 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tpm3P21107 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tpm3P21107 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tpm3P21107 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tpm3P21107 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tpm3P21107 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tpm3P21107 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tpm3P21107 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms