Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnnc2P20801 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnnc2P20801 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnnc2P20801 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnnc2P20801 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnnc2P20801 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnnc2P20801 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnnc2P20801 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnnc2P20801 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnnc2P20801 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnnc2P20801 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnnc2P20801 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnnc2P20801 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnnc2P20801 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnnc2P20801 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnnc2P20801 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnnc2P20801 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnnc2P20801 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnnc2P20801 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnnc2P20801 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnnc2P20801 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnnc2P20801 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnnc2P20801 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnnc2P20801 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnnc2P20801 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnnc2P20801 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnnc2P20801 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnnc2P20801 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnnc2P20801 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnnc2P20801 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnnc2P20801 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnnc2P20801 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnnc2P20801 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnnc2P20801 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnnc2P20801 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnnc2P20801 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnnc2P20801 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnnc2P20801 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnnc2P20801 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnnc2P20801 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnnc2P20801 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnnc2P20801 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnnc2P20801 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnnc2P20801 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnnc2P20801 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnnc2P20801 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnnc2P20801 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnnc2P20801 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnnc2P20801 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnnc2P20801 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnnc2P20801 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnnc2P20801 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnnc2P20801 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnnc2P20801 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnnc2P20801 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnnc2P20801 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnnc2P20801 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnnc2P20801 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnnc2P20801 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnnc2P20801 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnnc2P20801 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnnc2P20801 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnnc2P20801 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnnc2P20801 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnnc2P20801 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnnc2P20801 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnnc2P20801 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnnc2P20801 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnnc2P20801 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnnc2P20801 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnnc2P20801 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnnc2P20801 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnnc2P20801 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnnc2P20801 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnnc2P20801 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnnc2P20801 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnnc2P20801 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnnc2P20801 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnnc2P20801 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnnc2P20801 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnnc2P20801 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnnc2P20801 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnnc2P20801 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Tnnc2P20801 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnnc2P20801 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnnc2P20801 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnnc2P20801 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnnc2P20801 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnnc2P20801 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnnc2P20801 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnnc2P20801 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnnc2P20801 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnnc2P20801 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnnc2P20801 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnnc2P20801 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnnc2P20801 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnnc2P20801 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnnc2P20801 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnnc2P20801 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnnc2P20801 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.6 ms