Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Prim1P20664 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Prim1P20664 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Prim1P20664 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Prim1P20664 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prim1P20664 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prim1P20664 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prim1P20664 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prim1P20664 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prim1P20664 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prim1P20664 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Prim1P20664 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Prim1P20664 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Prim1P20664 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Prim1P20664 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Prim1P20664 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Prim1P20664 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Prim1P20664 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Prim1P20664 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Prim1P20664 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Prim1P20664 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Prim1P20664 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Prim1P20664 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Prim1P20664 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Prim1P20664 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Prim1P20664 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Prim1P20664 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Prim1P20664 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Prim1P20664 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Prim1P20664 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Prim1P20664 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Prim1P20664 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Prim1P20664 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Prim1P20664 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Prim1P20664 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Prim1P20664 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Prim1P20664 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Prim1P20664 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Prim1P20664 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Prim1P20664 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Prim1P20664 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Prim1P20664 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Prim1P20664 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Prim1P20664 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Prim1P20664 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Prim1P20664 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Prim1P20664 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Prim1P20664 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Prim1P20664 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Prim1P20664 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Prim1P20664 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Prim1P20664 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Prim1P20664 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Prim1P20664 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Prim1P20664 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Prim1P20664 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Prim1P20664 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Prim1P20664 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Prim1P20664 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Prim1P20664 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Prim1P20664 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Prim1P20664 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Prim1P20664 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Prim1P20664 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Prim1P20664 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Prim1P20664 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Prim1P20664 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Prim1P20664 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Prim1P20664 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Prim1P20664 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Prim1P20664 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Prim1P20664 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Prim1P20664 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Prim1P20664 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Prim1P20664 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Prim1P20664 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Prim1P20664 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Prim1P20664 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Prim1P20664 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Prim1P20664 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Prim1P20664 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Prim1P20664 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Prim1P20664 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Prim1P20664 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Prim1P20664 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Prim1P20664 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Prim1P20664 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Prim1P20664 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Prim1P20664 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Prim1P20664 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Prim1P20664 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Prim1P20664 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Prim1P20664 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Prim1P20664 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Prim1P20664 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Prim1P20664 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Prim1P20664 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Prim1P20664 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Prim1P20664 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Prim1P20664 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms