Protein–RNA interactions for Protein: P19137

Lama1, Laminin subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama1P19137 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lama1P19137 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lama1P19137 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lama1P19137 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lama1P19137 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Lama1P19137 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lama1P19137 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Lama1P19137 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lama1P19137 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lama1P19137 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lama1P19137 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lama1P19137 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lama1P19137 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lama1P19137 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lama1P19137 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Lama1P19137 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lama1P19137 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lama1P19137 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lama1P19137 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lama1P19137 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lama1P19137 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lama1P19137 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lama1P19137 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lama1P19137 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lama1P19137 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lama1P19137 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lama1P19137 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lama1P19137 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lama1P19137 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lama1P19137 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lama1P19137 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lama1P19137 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lama1P19137 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lama1P19137 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lama1P19137 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lama1P19137 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lama1P19137 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Lama1P19137 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lama1P19137 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lama1P19137 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lama1P19137 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lama1P19137 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lama1P19137 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lama1P19137 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lama1P19137 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lama1P19137 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lama1P19137 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lama1P19137 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lama1P19137 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lama1P19137 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Lama1P19137 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lama1P19137 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lama1P19137 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lama1P19137 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lama1P19137 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lama1P19137 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lama1P19137 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lama1P19137 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lama1P19137 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lama1P19137 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lama1P19137 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lama1P19137 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lama1P19137 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lama1P19137 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lama1P19137 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lama1P19137 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lama1P19137 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lama1P19137 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lama1P19137 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lama1P19137 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lama1P19137 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lama1P19137 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lama1P19137 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lama1P19137 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lama1P19137 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lama1P19137 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lama1P19137 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lama1P19137 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lama1P19137 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Lama1P19137 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lama1P19137 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lama1P19137 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lama1P19137 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lama1P19137 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lama1P19137 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lama1P19137 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lama1P19137 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lama1P19137 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lama1P19137 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lama1P19137 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lama1P19137 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lama1P19137 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lama1P19137 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lama1P19137 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lama1P19137 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lama1P19137 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lama1P19137 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lama1P19137 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lama1P19137 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lama1P19137 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms