Protein–RNA interactions for Protein: P18826

Phka1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phka1P18826 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Phka1P18826 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Phka1P18826 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Phka1P18826 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Phka1P18826 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Phka1P18826 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Phka1P18826 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Phka1P18826 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Phka1P18826 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Phka1P18826 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Phka1P18826 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Phka1P18826 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Phka1P18826 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Phka1P18826 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Phka1P18826 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Phka1P18826 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Phka1P18826 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Phka1P18826 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Phka1P18826 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Phka1P18826 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Phka1P18826 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Phka1P18826 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Phka1P18826 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Phka1P18826 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Phka1P18826 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Phka1P18826 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Phka1P18826 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Phka1P18826 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Phka1P18826 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Phka1P18826 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Phka1P18826 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Phka1P18826 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Phka1P18826 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Phka1P18826 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Phka1P18826 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Phka1P18826 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Phka1P18826 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Phka1P18826 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Phka1P18826 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Phka1P18826 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Phka1P18826 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Phka1P18826 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Phka1P18826 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Phka1P18826 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Phka1P18826 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Phka1P18826 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Phka1P18826 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Phka1P18826 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Phka1P18826 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Phka1P18826 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Phka1P18826 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Phka1P18826 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Phka1P18826 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Phka1P18826 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Phka1P18826 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Phka1P18826 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Phka1P18826 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Phka1P18826 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Phka1P18826 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Phka1P18826 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Phka1P18826 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Phka1P18826 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Phka1P18826 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Phka1P18826 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Phka1P18826 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Phka1P18826 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Phka1P18826 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Phka1P18826 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Phka1P18826 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Phka1P18826 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Phka1P18826 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Phka1P18826 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Phka1P18826 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Phka1P18826 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Phka1P18826 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Phka1P18826 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Phka1P18826 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Phka1P18826 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Phka1P18826 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Phka1P18826 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Phka1P18826 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Phka1P18826 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Phka1P18826 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Phka1P18826 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Phka1P18826 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Phka1P18826 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Phka1P18826 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Phka1P18826 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Phka1P18826 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Phka1P18826 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Phka1P18826 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Phka1P18826 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Phka1P18826 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Phka1P18826 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Phka1P18826 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Phka1P18826 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Phka1P18826 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Phka1P18826 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Phka1P18826 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Phka1P18826 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms