Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

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Length 98 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P18528 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P18528 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P18528 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
P18528 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P18528 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
P18528 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P18528 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P18528 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P18528 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P18528 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P18528 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
P18528 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
P18528 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P18528 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P18528 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P18528 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
P18528 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
P18528 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P18528 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P18528 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
P18528 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P18528 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P18528 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P18528 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
P18528 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
P18528 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
P18528 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P18528 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
P18528 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P18528 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P18528 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P18528 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
P18528 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P18528 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P18528 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P18528 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
P18528 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
P18528 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
P18528 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P18528 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P18528 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P18528 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P18528 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
P18528 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P18528 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P18528 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P18528 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P18528 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
P18528 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
P18528 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
P18528 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P18528 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
P18528 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P18528 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P18528 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P18528 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P18528 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P18528 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P18528 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P18528 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P18528 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P18528 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
P18528 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
P18528 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
P18528 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P18528 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P18528 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
P18528 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P18528 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P18528 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
P18528 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
P18528 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P18528 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
P18528 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P18528 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
P18528 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P18528 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P18528 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P18528 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P18528 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
P18528 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P18528 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P18528 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P18528 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P18528 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P18528 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P18528 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P18528 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P18528 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P18528 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
P18528 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P18528 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P18528 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P18528 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P18528 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P18528 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P18528 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P18528 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P18528 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms