Protein–RNA interactions for Protein: P13705

Msh3, DNA mismatch repair protein Msh3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh3P13705 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Msh3P13705 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Msh3P13705 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Msh3P13705 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Msh3P13705 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Msh3P13705 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Msh3P13705 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Msh3P13705 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Msh3P13705 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Msh3P13705 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Msh3P13705 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Msh3P13705 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Msh3P13705 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Msh3P13705 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Msh3P13705 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Msh3P13705 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Msh3P13705 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Msh3P13705 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Msh3P13705 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Msh3P13705 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Msh3P13705 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Msh3P13705 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Msh3P13705 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Msh3P13705 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Msh3P13705 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Msh3P13705 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Msh3P13705 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Msh3P13705 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Msh3P13705 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Msh3P13705 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Msh3P13705 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Msh3P13705 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Msh3P13705 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Msh3P13705 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Msh3P13705 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Msh3P13705 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Msh3P13705 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Msh3P13705 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Msh3P13705 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Msh3P13705 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Msh3P13705 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Msh3P13705 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Msh3P13705 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Msh3P13705 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Msh3P13705 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Msh3P13705 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Msh3P13705 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Msh3P13705 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Msh3P13705 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Msh3P13705 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Msh3P13705 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Msh3P13705 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Msh3P13705 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Msh3P13705 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Msh3P13705 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Msh3P13705 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Msh3P13705 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Msh3P13705 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Msh3P13705 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Msh3P13705 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Msh3P13705 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Msh3P13705 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Msh3P13705 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Msh3P13705 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Msh3P13705 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Msh3P13705 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Msh3P13705 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Msh3P13705 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Msh3P13705 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Msh3P13705 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Msh3P13705 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Msh3P13705 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Msh3P13705 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Msh3P13705 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Msh3P13705 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Msh3P13705 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Msh3P13705 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Msh3P13705 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Msh3P13705 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Msh3P13705 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Msh3P13705 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Msh3P13705 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Msh3P13705 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Msh3P13705 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Msh3P13705 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Msh3P13705 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Msh3P13705 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Msh3P13705 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Msh3P13705 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Msh3P13705 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Msh3P13705 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Msh3P13705 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Msh3P13705 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Msh3P13705 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Msh3P13705 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Msh3P13705 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Msh3P13705 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Msh3P13705 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Msh3P13705 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Msh3P13705 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.3 ms