Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Vpreb1P13372 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vpreb1P13372 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vpreb1P13372 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vpreb1P13372 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Vpreb1P13372 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vpreb1P13372 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vpreb1P13372 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vpreb1P13372 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vpreb1P13372 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vpreb1P13372 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vpreb1P13372 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vpreb1P13372 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vpreb1P13372 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vpreb1P13372 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Vpreb1P13372 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vpreb1P13372 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vpreb1P13372 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vpreb1P13372 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vpreb1P13372 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vpreb1P13372 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vpreb1P13372 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vpreb1P13372 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vpreb1P13372 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vpreb1P13372 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Vpreb1P13372 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vpreb1P13372 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vpreb1P13372 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vpreb1P13372 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vpreb1P13372 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vpreb1P13372 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vpreb1P13372 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vpreb1P13372 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vpreb1P13372 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vpreb1P13372 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Vpreb1P13372 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vpreb1P13372 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vpreb1P13372 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vpreb1P13372 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vpreb1P13372 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vpreb1P13372 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vpreb1P13372 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vpreb1P13372 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vpreb1P13372 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vpreb1P13372 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vpreb1P13372 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vpreb1P13372 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vpreb1P13372 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vpreb1P13372 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vpreb1P13372 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vpreb1P13372 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vpreb1P13372 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vpreb1P13372 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vpreb1P13372 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Vpreb1P13372 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vpreb1P13372 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vpreb1P13372 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vpreb1P13372 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vpreb1P13372 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vpreb1P13372 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vpreb1P13372 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vpreb1P13372 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vpreb1P13372 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vpreb1P13372 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vpreb1P13372 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vpreb1P13372 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vpreb1P13372 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vpreb1P13372 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vpreb1P13372 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Vpreb1P13372 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vpreb1P13372 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vpreb1P13372 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vpreb1P13372 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vpreb1P13372 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vpreb1P13372 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vpreb1P13372 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Vpreb1P13372 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vpreb1P13372 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Vpreb1P13372 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vpreb1P13372 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vpreb1P13372 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vpreb1P13372 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vpreb1P13372 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vpreb1P13372 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vpreb1P13372 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vpreb1P13372 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vpreb1P13372 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vpreb1P13372 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vpreb1P13372 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vpreb1P13372 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vpreb1P13372 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vpreb1P13372 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vpreb1P13372 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vpreb1P13372 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vpreb1P13372 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vpreb1P13372 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vpreb1P13372 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vpreb1P13372 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vpreb1P13372 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vpreb1P13372 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89 ms