Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Amd1P0DMN7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Amd1P0DMN7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Amd1P0DMN7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Amd1P0DMN7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Amd1P0DMN7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Amd1P0DMN7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Amd1P0DMN7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Amd1P0DMN7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Amd1P0DMN7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Amd1P0DMN7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Amd1P0DMN7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Amd1P0DMN7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Amd1P0DMN7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Amd1P0DMN7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Amd1P0DMN7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Amd1P0DMN7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Amd1P0DMN7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Amd1P0DMN7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Amd1P0DMN7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Amd1P0DMN7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Amd1P0DMN7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Amd1P0DMN7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Amd1P0DMN7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Amd1P0DMN7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Amd1P0DMN7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Amd1P0DMN7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Amd1P0DMN7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Amd1P0DMN7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Amd1P0DMN7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Amd1P0DMN7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Amd1P0DMN7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Amd1P0DMN7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Amd1P0DMN7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Amd1P0DMN7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Amd1P0DMN7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Amd1P0DMN7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Amd1P0DMN7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Amd1P0DMN7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Amd1P0DMN7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Amd1P0DMN7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Amd1P0DMN7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Amd1P0DMN7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Amd1P0DMN7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Amd1P0DMN7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Amd1P0DMN7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Amd1P0DMN7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Amd1P0DMN7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Amd1P0DMN7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Amd1P0DMN7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Amd1P0DMN7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Amd1P0DMN7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Amd1P0DMN7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Amd1P0DMN7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Amd1P0DMN7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Amd1P0DMN7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Amd1P0DMN7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Amd1P0DMN7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Amd1P0DMN7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Amd1P0DMN7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Amd1P0DMN7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Amd1P0DMN7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Amd1P0DMN7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Amd1P0DMN7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Amd1P0DMN7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Amd1P0DMN7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Amd1P0DMN7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Amd1P0DMN7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Amd1P0DMN7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Amd1P0DMN7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Amd1P0DMN7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Amd1P0DMN7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Amd1P0DMN7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Amd1P0DMN7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Amd1P0DMN7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Amd1P0DMN7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Amd1P0DMN7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Amd1P0DMN7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Amd1P0DMN7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Amd1P0DMN7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Amd1P0DMN7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Amd1P0DMN7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Amd1P0DMN7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Amd1P0DMN7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Amd1P0DMN7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Amd1P0DMN7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Amd1P0DMN7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Amd1P0DMN7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Amd1P0DMN7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Amd1P0DMN7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Amd1P0DMN7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Amd1P0DMN7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Amd1P0DMN7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Amd1P0DMN7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Amd1P0DMN7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Amd1P0DMN7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Amd1P0DMN7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Amd1P0DMN7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Amd1P0DMN7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Amd1P0DMN7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms