Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxb2P0C1T1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxb2P0C1T1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxb2P0C1T1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxb2P0C1T1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxb2P0C1T1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxb2P0C1T1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb2P0C1T1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb2P0C1T1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb2P0C1T1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb2P0C1T1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb2P0C1T1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb2P0C1T1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb2P0C1T1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb2P0C1T1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb2P0C1T1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb2P0C1T1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb2P0C1T1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb2P0C1T1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb2P0C1T1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb2P0C1T1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb2P0C1T1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb2P0C1T1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb2P0C1T1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb2P0C1T1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb2P0C1T1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb2P0C1T1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb2P0C1T1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb2P0C1T1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb2P0C1T1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb2P0C1T1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb2P0C1T1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb2P0C1T1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb2P0C1T1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb2P0C1T1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb2P0C1T1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb2P0C1T1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb2P0C1T1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb2P0C1T1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb2P0C1T1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb2P0C1T1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb2P0C1T1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb2P0C1T1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb2P0C1T1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb2P0C1T1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb2P0C1T1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb2P0C1T1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb2P0C1T1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb2P0C1T1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb2P0C1T1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb2P0C1T1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb2P0C1T1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb2P0C1T1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb2P0C1T1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb2P0C1T1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxb2P0C1T1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxb2P0C1T1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxb2P0C1T1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxb2P0C1T1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxb2P0C1T1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxb2P0C1T1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxb2P0C1T1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxb2P0C1T1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxb2P0C1T1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxb2P0C1T1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxb2P0C1T1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxb2P0C1T1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxb2P0C1T1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxb2P0C1T1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxb2P0C1T1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hoxb2P0C1T1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hoxb2P0C1T1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hoxb2P0C1T1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hoxb2P0C1T1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxb2P0C1T1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxb2P0C1T1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxb2P0C1T1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxb2P0C1T1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxb2P0C1T1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxb2P0C1T1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxb2P0C1T1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxb2P0C1T1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxb2P0C1T1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxb2P0C1T1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxb2P0C1T1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxb2P0C1T1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxb2P0C1T1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxb2P0C1T1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxb2P0C1T1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxb2P0C1T1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxb2P0C1T1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxb2P0C1T1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxb2P0C1T1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxb2P0C1T1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxb2P0C1T1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxb2P0C1T1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxb2P0C1T1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxb2P0C1T1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxb2P0C1T1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxb2P0C1T1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms