Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxb3P09026 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxb3P09026 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxb3P09026 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxb3P09026 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxb3P09026 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hoxb3P09026 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hoxb3P09026 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxb3P09026 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxb3P09026 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxb3P09026 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxb3P09026 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxb3P09026 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxb3P09026 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxb3P09026 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxb3P09026 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxb3P09026 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxb3P09026 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxb3P09026 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxb3P09026 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxb3P09026 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxb3P09026 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxb3P09026 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxb3P09026 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxb3P09026 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxb3P09026 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxb3P09026 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxb3P09026 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxb3P09026 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxb3P09026 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxb3P09026 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxb3P09026 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxb3P09026 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxb3P09026 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxb3P09026 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxb3P09026 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxb3P09026 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxb3P09026 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxb3P09026 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxb3P09026 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxb3P09026 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxb3P09026 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxb3P09026 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxb3P09026 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxb3P09026 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxb3P09026 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxb3P09026 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxb3P09026 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxb3P09026 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxb3P09026 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxb3P09026 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxb3P09026 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxb3P09026 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxb3P09026 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxb3P09026 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxb3P09026 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxb3P09026 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxb3P09026 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxb3P09026 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxb3P09026 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Hoxb3P09026 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxb3P09026 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxb3P09026 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxb3P09026 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxb3P09026 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxb3P09026 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxb3P09026 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxb3P09026 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxb3P09026 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxb3P09026 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxb3P09026 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxb3P09026 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxb3P09026 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxb3P09026 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxb3P09026 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxb3P09026 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxb3P09026 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxb3P09026 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxb3P09026 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxb3P09026 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxb3P09026 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxb3P09026 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxb3P09026 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxb3P09026 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxb3P09026 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxb3P09026 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxb3P09026 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxb3P09026 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxb3P09026 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxb3P09026 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxb3P09026 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxb3P09026 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxb3P09026 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxb3P09026 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxb3P09026 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxb3P09026 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxb3P09026 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxb3P09026 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxb3P09026 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxb3P09026 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms