Protein–RNA interactions for Protein: P05784

Krt18, Keratin, type I cytoskeletal 18, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt18P05784 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt18P05784 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt18P05784 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt18P05784 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt18P05784 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt18P05784 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt18P05784 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt18P05784 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt18P05784 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt18P05784 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt18P05784 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt18P05784 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt18P05784 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt18P05784 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt18P05784 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt18P05784 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt18P05784 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt18P05784 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt18P05784 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt18P05784 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt18P05784 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt18P05784 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt18P05784 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt18P05784 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt18P05784 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt18P05784 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt18P05784 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt18P05784 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt18P05784 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt18P05784 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt18P05784 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt18P05784 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt18P05784 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt18P05784 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt18P05784 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt18P05784 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt18P05784 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt18P05784 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt18P05784 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt18P05784 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt18P05784 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt18P05784 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Krt18P05784 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt18P05784 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt18P05784 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt18P05784 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt18P05784 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt18P05784 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt18P05784 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt18P05784 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt18P05784 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt18P05784 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt18P05784 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt18P05784 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt18P05784 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt18P05784 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt18P05784 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt18P05784 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt18P05784 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt18P05784 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt18P05784 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt18P05784 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt18P05784 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt18P05784 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt18P05784 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt18P05784 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt18P05784 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt18P05784 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt18P05784 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt18P05784 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt18P05784 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt18P05784 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt18P05784 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt18P05784 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt18P05784 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt18P05784 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt18P05784 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt18P05784 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Krt18P05784 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Krt18P05784 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Krt18P05784 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Krt18P05784 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Krt18P05784 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Krt18P05784 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Krt18P05784 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Krt18P05784 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt18P05784 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt18P05784 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt18P05784 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt18P05784 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt18P05784 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt18P05784 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt18P05784 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt18P05784 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt18P05784 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt18P05784 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt18P05784 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt18P05784 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt18P05784 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt18P05784 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 258.1 ms